背景
歐洲文藝復興以後，商業貿易發展起來，各國人民交往頻繁。人們對植、動物的知識豐富了，系統地整理和對植、動物的統一命名就顯得迫切需要了。在這樣的歷史條件下，瑞典博物學家林奈於1735年出版了“自然系統”（Systema Naturae）這一名著。此書到 1768年共出了 12版。林奈不相信生物進化，他認為物種不會改變，即物種彼此之存在親緣的關係，因而他的分類系統是不可能反映各種生物在進化上的地位的人為的分類系統。但是他鑑定物種所選用的性狀大多是有同源關係的，是可以比較的，因此他的分類系統至今仍是有意義的。
基本內容
生物的分界一、兩界說（1753年瑞典林奈）
1、植物界：進行光合作用，不能自由運動；
2、動物界：能自由運動，以植物或其它有機物為食。
二、五界說（1969年由惠特克提出的對細胞生物的分界）
1、原核生物界：細菌、藍藻等，DNA裸露，裂殖。
2、原生生物界：單細胞真核生物（甲藻、金藻、裸藻、粘菌和原生動物），有真正的染色體，進行有絲和減數分裂。[酵母菌、衣藻等例外]
3、真菌界：酵母菌、黴菌和大型真菌，生活方式為腐生和寄生。
4、植物界：藻類、苔蘚、蕨類和種子植物，進行光合作用。
5、動物界：多細胞動物，包括無脊椎動物和脊椎動物。
附：加病毒界為六界。
一、生物分類階梯：界、門、綱、目、科、屬、種
二、“雙名法”（林奈）：用拉丁文給植物的種定名
屬名（字頭大寫，多為名詞）+種加詞（多為形容詞）+定名人姓名（多用縮寫）[+變種名+定名人]
微生物學
一、病毒1、概念：病毒是超顯微的、無細胞結構、專性活細胞寄生的大分子微生物。
2、種類：植物病毒、動物病毒和噬菌體（細菌病毒）
3、特性：
⑴個體極小（納米）
⑵專性寄生：無獨立代謝活動，只在特定宿主中繁殖，在宿主體外不進行任何形式的代謝，不具備任何生命特徵。
⑶無細胞結構，化學組成與繁殖方式簡單：
①化學組成：
蛋白質+核酸
蛋白質：保護、特異親和力、抗原性
核酸（含單一類型的DNA和RNA）
動物病毒（DNA、RNA、單鏈、雙鏈）
植物病毒（RNA、單鏈、雙鏈）
噬菌體（DNA、單鏈、雙鏈）
②繁殖方式：為仰賴於宿主細胞進行複製繁殖[講解噬菌體侵染細菌實驗]
吸附—侵入—複製—合成—組裝—釋放
附：類病毒（游離的核酸致病體）
（一）細菌（根瘤菌）
1、形態（個體微小、形態多樣）
⑴、球菌（單球菌、雙球菌、鏈球菌、葡萄球菌）
⑵、桿菌
⑶、螺鏇菌
2、結構
⑴、常規結構：由細胞壁（肽聚糖）、細胞膜、細胞質（核糖體）、核區（DNA裸露）
⑵、附屬結構：莢膜（多糖或多肽，有保護作用）、鞭毛（蛋白質，協助運動）、芽孢（細菌生長一定階段後形成的休眠體，含水量低、耐熱性強，對不良環境有極強的抗性）
3、營養方式
同化作用方面
⑴、多數為異養
①腐生細菌（枯草桿菌）
②寄生細菌（痢疾桿菌）
⑵、少數自養
①光合細菌
綠硫細菌：6CO2+12H2S→C6H12O6+6H2O+12S（光能+細菌葉綠素）
②化能合成細菌（利用無機物氧化提供的能量，將CO2合成有機物）
硝化細菌（氨→亞硝酸）
硫細菌（硫化物→硫→硫酸）
鐵細菌（亞鐵→高鐵）
⑶、兼性自養（氫細菌：氫→水）
異化作用方面
⑴、多數為好氧細菌
⑵、厭氧細菌（乳酸菌發酵）
⑶、兼性厭氧細菌：硝酸鹽還原細菌
⑷、微量好氧細菌：擬桿菌屬中的個別種
4、二分分裂生殖，繁殖能力強
核分裂→形成橫隔壁→子細胞分離
5、研究方法
⑴、顯微鏡
⑵、培養基
⑶、革蘭氏染色[染色（草酸銨+碘）→脫色（乙醇）→再染色（蕃紅）]
陽性：不脫色
陰性：脫色並染上蕃紅的顏色
（二）藍藻（最早的原核藍藻出現於35—33億年前）[念珠藻（地木耳、髮菜）、色球藻]
1、形態結構
⑴、單細胞、群體。
⑵、與細菌常規結構相似（細胞壁外有膠質鞘）
2、營養方式（光合作用）
⑴、色素（葉綠素A、類胡蘿蔔素、藻藍素和藻紅素），外部顏色不一。
⑵、載色體
3、分裂生殖
附：原綠藻
（三）放線菌[介於細菌和真菌之間、引發土壤的泥腥味]
1、形態結構
⑴、單細胞、呈放射狀的菌絲體。
⑵、菌絲分為營養菌絲（吸收養料）和氣生菌絲
2、營養方式
多數為需氧呼吸，營腐生生活。
3、生殖方式（孢子生殖）
⑴、氣生菌絲形成孢子絲
⑵、孢子絲成熟形成分生孢子
⑶、孢子萌發形成新菌絲體
4、特殊作用：產生抗生素。
（四）其它原核生物（細菌——枝原體——立克次氏體——衣原體——病毒）
1、立克次氏體：具細胞結構，專性細胞內寄生，分裂繁殖。
2、枝原體：具細胞結構，無細胞壁，是最小的原核生物；多數營腐生生活；進行分裂生殖或出芽生殖。
3、衣原體：有細胞結構，專性細胞內寄生；分裂生殖。
（單細胞真核生物及單細胞群體）
真核生物中最低等的類型，植物界、動物界和真菌界都起源於原生生物。
1、甲藻門（多甲藻）
纖維素組成的板塊狀細胞壁、草鞭型鞭毛（9+2）、片狀葉綠體，是活化石。
2、金藻門（硅藻）
矽質化堅硬細胞壁、分裂生殖、精子為草鞭型鞭毛（9+2）。
3、裸藻門（眼蟲藻）
無細胞壁、草鞭型鞭毛（9+2）、有鮮綠色葉綠體、有眼點（感光），能運動、儲蓄泡和伸縮泡、裂殖。環境不利時可分沁膠質形成胞囊。在有機質豐富而不見光處可分裂形成異養類型，有人認為這是動植物共同的原祖。
4、粘菌門（粘菌）
⑴、介於動物和真菌之間的生物
⑵、營養期：裸露的，無細胞壁的多核原生質團——變形體（與動物中變形蟲相似）
⑶、繁殖期：產生具纖維素細胞壁的孢子（具真菌性狀）。
5、原生動物門
⑴、特徵：
①單細胞或群體、多數種類體形微小；
②原始性、現在的原生動物卻不是各類動物的原祖；
③3種營養方式：
植物性營養（光合營養）、動物性營養（吞噬營養）、滲透性營養（腐生營養）
④有細胞內分化形成各種細胞器
⑵、分類：
①肉足蟲綱（變形蟲）運動胞器這偽足併兼攝食功能；
②纖毛蟲綱（草履蟲）運動胞器為纖毛，有大核（營養）、小核（生殖）
③孢子蟲綱（瘧原蟲）無運動胞器，全營寄生生活，有人體和雌按蚊雙寄主。
附：鞭毛蟲綱（綠眼蟲）運動胞器為一根或多根鞭毛
⑶、草履蟲其餘特徵介紹：
①食物——胞口——食物泡——胞肛（藍墨水實驗）
②表膜進行呼吸
③細胞質分為內質（流動）和外質（有刺絲泡）
④排泄廢物——伸縮泡和收集管
1、主要特徵：
具細胞壁、無根、莖、葉分化、不含葉綠素、營腐生或寄生生活。
2、分類：（三綱一類）
⑴、藻狀菌綱（接合菌綱）：根霉、毛霉（可制酒麴）等
分支絲狀體、無橫隔、多核。孢子生殖（孢囊孢子或分生孢子）、有性生殖（接合生殖）
⑵、子囊菌綱：酵母菌、青黴、冬蟲夏草等
菌絲分隔、單核，出芽生殖（酵母）、孢子生殖（分生孢子）、有性生殖（子囊孢子）
⑶、擔子菌綱：蘑菇、靈芝等
菌絲分隔、初生菌絲單核，次生雙核。出芽生殖、孢子生殖（分生孢子、粉孢子）、有性生殖（擔孢子）
⑷、半知菌類
3、酵母菌
⑴、卵形單細胞生物
⑵、不含葉綠素，營腐生生活
⑶、有氧時：有氧呼吸，產生二氧化碳和水
無氧時：無氧呼吸，產生二氧化碳和酒精
⑷、環境好：出芽生殖
環境差：孢子生殖
亦可進行有性生殖（子囊孢子）
4、黴菌
⑴、絲狀真菌：菌絲體分無隔菌絲（根霉、毛霉）和有隔菌絲（青黴、麴黴）
⑵、無葉綠素、腐生生活（少數寄生）：菌絲體分營養菌絲（吸收養料）和氣生菌絲（上生孢子、與繁殖有關）
有氧呼吸（少數無氧呼吸）
⑶、孢子生殖（孢囊孢子和分生孢子）
5、大型真菌（各類食用菌和藥用菌）
⑴、由菌絲體（營養並分化形成子實體）和子實體（繁殖）組成
⑵、孢子生殖
（一）藻類植物（最早出現的水生低等植物，結構簡單，無根、莖、葉的分化，含葉綠素，進行光合作用）
1、綠藻門（藻類植物最大的一個門，在植物界的系統發育中居於主幹地位。）
⑴、衣藻（單細胞、雙鞭毛、紅色眼點、杯狀葉綠體、孢子生殖和同配生殖）
⑵、團藻（多細胞空心球體，內充滿膠質和水。卵式生殖）
⑶、水綿（絲狀體、帶狀葉綠體、斷裂生殖和接合生殖）
同型世代交替（有性世代[配子體世代]與無性世代[孢子體世代]交替出現）
2、褐藻門（海帶：含藻黃素和葉綠素）
3、紅藻門（紫菜：含藻紅素和葉綠素）
附：①、兩界說的藻類植物
②、兩界說的菌類植物（細胞門、粘菌門、真菌門）
③、兩界說的地衣植物（真菌和藻類的共生體，能分泌地衣酸變岩石表面為土壤，是植物界的開路先鋒）
（二）苔蘚植物（地錢、葫蘆蘚）
1、小型多細胞綠色植物，水生到陸生的過渡類型。
2、有假根、莖和葉，但無輸導組織。
3、異型世代交替，配子體（n）發達，孢子體（2n）寄生。
4、受精過程藉助於水。
5、有頸卵器和胚出現，屬高等植物。
（三）蕨類植物（蕨、石松、木賊、松葉蘭）
1、有根、莖、葉的分化，
2、內部出現維管系統，屬維管植物：
木質部（管胞和導管）和韌皮部（篩孢和篩管）。
3、異型世代交替，孢子體、配子體均能獨立生活。
4、孢子生殖，屬孢子植物。
5、受精過程藉助於水。
（四）種子植物之一——裸子植物
1、孢子體發達，形成高大喬木，配子體寄生。
2、種子裸露，外無果皮包被。
3、維管束中有形成層。木質部（有管胞無導管）和韌皮部（有篩管無伴孢）。
4、分類：
⑴、蘇鐵科：蘇鐵
⑵、銀杏科：銀杏
⑶、松科：雪松
⑷、杉科：水杉
⑸、柏科：側柏
（五）種子植物之二——被子植物
1、被子植物的一般特徵：
⑴、具有真正的花。
⑵、胚珠包藏在雌蕊子房內。
⑶、具有雙受精現象。
⑷、孢子體高度發達，配子體進一步退化。
2、被子植物花的表示：
⑴、花程式：
⑵、花圖解：
⑶、花序：
3、被子植物的分類
雙子葉植物綱
⑴、木蘭科
⑵、毛莨科
⑶、豆科
①含羞草亞科
②蘇木亞科
③蝶形花亞科
⑷、十字花科
⑸薔薇科
①繡線菊亞科
②薔薇亞科
③蘋果亞科
④梅亞科
⑹、葫蘆科
⑺、芸香科
⑻、殼斗科
⑼、錦葵科
單子葉植物綱
⑽禾本科
由於動物種類繁多，對於某一些類群目前還缺乏深入的研究和了解，因此，直到現在對全世界動物的分類都還沒有一個比較完善的分類系統。有的將它們分為33個門，如J.E. Webb等1978；也有的將它們分為30個門，如R.M. Alexender l979；也有的將它們分為28 個門，如w.A. Johnson。這些差異的原因，在於有的學者將若干有差異的綱都已提升為門，如原假體腔動物中的輪蟲、腹毛、動吻、線形、線蟲等綱動物，一些學者均將其提升為門；另外有一些新的類群被發現，放在原有的各門中均覺不合適，索興新建立為單獨的一門，如櫛水母動物門，即由於發現了櫛水母動物等。對於藥用動物的研究來說，早期如《藥材學》1960，將其劃分為10門，後來《中藥鑑定學》1977等也都採用，為了研究、敘述上的方便，本章仍採用此一分類系統，仍將動物界劃分為10門。根據的特徵仍然是：細胞的分化，胚層的形成，體腔的有無，對稱的形式，體節的劃分，骨骼的性質，附肢的特點，以及其他器官系統的發生和發展，並參照了地質學上關於地層的劃分等資料。現將動物界10門動物分述如下：
(1)原主動物門Protozoa
都是單細胞動物，少數聚合形成群體，自由生活於水中或濕土內，一部分並營寄生生活，具無性或有性生殖。本門無藥用動物種類，但在進化上為原始類群，與人類生活關係也十分密切，某些寄生種類對人類的健康和經濟動物的養殖，可造成極大的危害。
因運動方式的不同可分為4綱：
1)．鞭毛蟲綱Mastigophora
用鞭毛運動，有鞭毛l～數條。如眼蟲Euglena viridis。
2)．肉足蟲綱Sarcodina
用偽足運動，即體表無固定表膜，原生質可向各方突出，作為運動和捕食的細胞器官。如變形蟲amoeba Pr0teus。
3)．孢子蟲綱Sporozoa
全部寄生，生活史中產生孢子。如瘧原蟲Plasm0dium。
4)．纖毛蟲綱Ciliata
用纖毛運動，即體表有眾多纖毛。如草履蟲Paramecium caudatum。
(2)海綿動物門Spongia
又稱多孔動物門（Porifera），是生活在水中的最原始的多細胞動物，細胞雖有分化，但不構成組織。細胞可排列為2層，但不分化為內外2個胚層，體內有管道系統，由水中獲得食物，還有骨針以支持和保護身體。如脆針海綿Sp0ngiLLa Fragilis，可供藥用。
(3)腔腸動物門Coelenterata
體形輻射對稱，體壁由內外二層細胞組成，外層為外胚層，內層為內胚層，具有原口，某些種類並可結合成群體，而在個體之間有形態與功能上的分工，大多為海水生，淡水生者極少。如海蜇Rhopiloma esculenta，可供藥用。
(4)扁形動物門Platyhelminthes
兩側對稱，身體分化為外、中、內三個胚層，即開始出現了中胚層，身體柔軟無體腔，大都雌雄同體，排泄系統有焰細胞，自由生活於水中、陸地，某些種為寄生。本門目前無藥用動物種類。如渦蟲Planaria。
(5)線形動物門Nemathelminthes
身體一般呈長線狀或圓筒狀，三胚層有原體腔，不分節，體表被一層半透明的彈性角質膜，消化管末端具有肛門，大都為雌雄異體，自由生活于海水、淡水及土壤中，並有很多是寄生的。如蛔蟲Ascaris lumnbricoides，據本草記載可供藥用。
(6)環節動物門Annelida
身體圓筒形，分成若干同形的環節，內部各系統分化趨於完善，有真體腔，體表具剛毛或疣足，雌雄異體或同體，直接發育或有變態，產生擔輪幼蟲，大部分自由生活于海水、淡水及土壤中，少數並可奇生。如蚯蚓Pheretima aspergillum，可供藥用。
(7)軟體動物門Mollusca
身體具有外套膜，體表有介殼，足富於肌肉稱肉足，常位於身體的腹面，本門動物生活于海水、淡水和陸地，已知約有10萬種，為動物界中第二大門。如田螺Cipangopaludinachinsis （Gray），可供藥用。
(8)節肢動物門ArthropOda
身體兩側對稱，具有異型體節（如頭、胸、腹）和分節的附肢，體表有幾丁質、石灰質構成的外骨骼，體腔不發達，肌肉分離為肌束，循環係為開管型，已知約有92萬3千種，為動物界中第一大門。如蜈蚣Scolopendra subspinipes mutilans，可供藥用。
(9)棘皮動物門Echinodermata
身體有由中胚層形成的內骨骼，體表有棘，具後口，真體腔發達，具有特殊的水管系或步管系統。如海膽Anth0cidaris crassispina （A. Agassiz），可供藥用。以上各門動物其身體背部均不具脊索（或脊椎），無中樞神經系，或有呈鏈狀，位於消化道腹面，循環系統的主要部位在消化道背面，大多無骨骼，或僅有外骨骼，又合稱為無脊椎動物，為低等類型，以別於下述的脊椎動物。
(10)脊索動物門Chordata
具有脊索（或被分節的脊椎所代替）、背神經管和腮裂（或為腮囊），有後口的動物。己知約有4萬1千2百餘種，為動物界中第三大門。本門動物又可分為尾索動物亞門（Urochordata）、頭索動物亞門（cephalochordata）、脊椎動物亞門（Vertebrata）等3個亞門。其中脊椎動物亞門，種類多，經濟價值大，在進化中是最高等的類型，現今很多物學家已將其獨立成為一門。如海馬Hipp0campus japonicus Kaup，可供藥用。
