內部核糖體進入位點

第一類IRES(見於腸病毒和鼻病毒)並不是非常有效的翻譯起始體。 第二類IRES(見於cardioviruses aphthoviruses)則是有效的翻譯起始體。

簡介

內部核糖體進入位點,縮寫IRES,是一段核酸序列,它的存在能夠使蛋白質翻譯起始不依賴於5‘帽結構,從而使直接從信使RNA(mRNA)中間起始翻譯成為可能。通常來講,真核生物翻譯只能從mRNA的5‘端開始,因為翻譯起始必須依賴於5’端的帽子結構。一般來講,內部核糖體進入位點通常位於RNA病毒基因組的5’非翻譯區(UTR),這樣病毒蛋白的翻譯就可以不依賴於5‘帽子結構。

分類

根據其序列特徵和二級結構的保守性,可以將那邊核糖體進入位點分為三類。第一類IRES(見於腸病毒和鼻病毒)並不是非常有效的翻譯起始體。第二類IRES(見於cardioviruses and aphthoviruses)則是有效的翻譯起始體。第三類(見於A肝病毒)則位於兩者之間,也不是非常有效。當然,IRES的活性與所使用的細胞系是有關係的。

套用

IRES常用構建於真核生物雙順反子(bicistronic mRNA)中間,如此一來,第一個蛋白通常靠5’帽子結構起始翻譯,而第二個蛋白則依靠IRES起始翻譯。IRES前後的兩個蛋白的表達通常是成比例的,因此可以根據其中一個報告基因的表達情況來反映另外一個蛋白的表達情況。

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