車站月台
兆康站設有2個月台，並以島式月台的方式排列，所有月台均在車站興建時裝設月台幕門。車站月台位於屯門河上方以高架形式興建，但月台與位於地面的輕鐵月台平排。
車站出口
A - 彩暉花園、河傍公園、屯門醫院
設有失明人士引導逕往返出口
B - 輕鐵
B1 - 輕鐵2號月台，設有失明人士引導逕往返地面 。
B2 - 同B1，方向不同，設有失明人士引導逕往返地面 。
C - 兆康苑
C1 - 輕鐵1號月台、輕鐵5號月台、輕鐵3號月台（並沒有任何輕鐵路線使用），設有失明人士引導逕往返地面 。
C2 - 輕鐵6號月台、青山醫院、麒麟圍、兆康苑、紫田村 。
C3 - 同C1出口，只是上下輕鐵站的方向，設有失明人士引導逕往返地面 。
D - 失物及學生乘車優惠計畫辦事處、輕鐵2號月台、兆康苑平台，設有升降機及失明人士引導逕往返地面 。
E - 新慶村、茵翠豪庭，設有失明人士引導逕往返出口 。
F - 嶺南大學、聚康山莊、清涼法苑、富泰邨、興德學校、名賢居、疊茵庭，設有斜道往返地面。
鄰接車站
兆康站是西鐵線的中途站，乘客可在此乘坐往紅磡或屯門列車，往返九龍及新界等地。
利用狀況
由於兆康站是輕鐵的轉乘車站，再加上是輕鐵的中心點，因此有不少乘客使用本站。加上兆康苑對外巴士線不多，所以有不少兆康苑居民坐西鐵線出市區。
接駁交通
兆康站在九廣西鐵興建前，九廣鐵路公司早已於當地設立輕鐵兆康站，因此九廣西鐵設計初期，早已計畫將兆康站發展成為西鐵及輕鐵的綜合轉乘車站，所以車站設有大量行人通道連線輕鐵月台，方便乘客由西鐵線轉乘輕鐵路線往返屯門各區。
此外，兆康站的南北兩端設有2個公共運輸交匯處，交匯處分別為兆康站（南）公共運輸交匯處及兆康站（北）公共運輸交匯處，設有巴士、小巴及的士站，並設有港鐵巴士路線K51及K58可供乘客轉乘巴士前往富泰邨、大欖或青山灣等地。
