上海水產大學生物技術研究中心是實現跨系跨學院相互合作，充分發揮學校科技綜合優勢而建立的一個利用生物技術來研究開發利用水產生物的多學科聯合的研究機構。目前主要研究方向為：1.水產動物遺傳育種，2.海藻生物技術，3.魚病生物工程，4.魚類及甲殼動物生殖與內分泌生理，5.水產動物酶學及酶工程。
