檢測
非組蛋白特性
非組蛋白2、多樣性：非組蛋白占染色質蛋白的60%~70%，不同組織細胞中其種類和數量都不相同，代謝周轉快。包括多種參與核酸代謝與修飾的酶類如DNA聚合酶和RNA聚合酶、HGM蛋白（highmobilitygroupprotein）、染色體支架蛋白、肌動蛋白和基因表達蛋白等。
3、特異性：能識別特異的DNA序列，識別信息來源於DNA核苷酸序列本身，識別位點存在於DNA雙螺鏇的大溝部分，識別與結合靠氫鍵和離子鍵。在不同的基因組之間，這些非組蛋白所識別的DNA序列在進化上是保守的。這類序列特異性DNA結合蛋白具有一個共同特徵，即形成與DNA結合的螺鏇區並具有蛋白二聚化的能力。
4、功能多樣性：雖然與DNA特異序列結合的蛋白質在每一個真核細胞中只有10000個分子左右，約占細胞總蛋白的1/50000，但具有多方面的重要功能，包括基因表達的調控和染色質高級結構的形成。如幫助DNA分子摺疊，以形成不同的結構域；協助啟動DNA複製，控制基因轉錄，調節基因表達等。
結構模式
雖然非組蛋白種類眾多，但是根據它們與DNA結合的結構域不同，可分為不同的家族。
α螺鏇-轉角-α螺鏇模式
（helix-turn-helixmotif）
這是最早在原核基因的激活蛋白和阻抑物中發
現的。迄今已經在百種以上原核細胞和真核生物中發現這種最簡單、最普遍的DNA結合蛋白的結構模式。這種蛋白與DNA結合時，形成對稱的同型二聚體（symmetrichomodimer）結構模式。構成同型二聚體的每個單體由20個胺基酸的小肽組成α螺鏇-轉角-α螺鏇結構，兩個α螺鏇相互連線構成β轉角，其中羧基端的α螺鏇為識別螺鏇（recognitionhelix），負責識別DNA大溝的特異鹼基信息，另一個α螺鏇沒有鹼基特異性，與DNA磷酸戊糖鏈骨架接觸。這種蛋白在與DNA特異結合時，以二聚體形式發揮作用，結合靠蛋白質的胺基酸側鏈與特異鹼基對之間形成氫鍵。
（zincfingermotif）
負責5SRNA、tRNA和部分snRNA基因轉錄的RNA
聚合酶Ⅲ所必須的轉錄因子。TFⅢA是首先被發現的鋅指蛋白，由344個胺基酸組成。TFⅢA含有9個有規律的鋅指重複單位，每個單位30個胺基酸殘基，其中一對半胱氨酸和一對組氨酸與Zn2+形成配位鍵。每個鋅指單位是一個DNA結合結構域（DNA-bindingdomain），每個鋅指的C末端形成α螺鏇負責與DNA結合。這類Cys2/His2鋅指單位的共有序列（consensussequence）是：Cys-X2~4-Cys-X3-Leu-X2-His-X3-His。哺乳類轉錄因子SP1也有類似的鋅指結構，由三個鋅指單位組成。另一類鋅指蛋白含兩對半胱氨酸，而不含組氨酸，如哺乳類細胞的甾體類激素受體蛋白。這類Cys2/Cys2鋅指單位的結合Zn2+的共有序列是：Cys-X2-Cys-X13-Cys-X2-Cys。不同的鋅指識別不同的鹼基序列，因為不同鋅指的胺基酸組成不一樣。
非組蛋白在構建轉錄複合物過程中，普遍涉及蛋白與蛋白
之間的相互作用，形成二聚體是識別特異DNA序列蛋白的相互作用的共同原則，亮氨酸拉鏈就是富含Leu殘基的一段胺基酸序列所組成的二聚化結構。這類序列特異性DNA結合蛋白家族，包括酵母的轉錄激活因子（GCN4）、癌蛋白Jun、Fos、Myc以及增強子結合蛋白（enhancerbindingprotein，C/EBP）等。所有這些蛋白的肽鏈羧基端約35個胺基酸殘基有形成α螺鏇的特點，每兩圈（7個胺基酸殘基）有一個亮氨酸殘基。這樣，在α螺鏇一側的Leu排成一排，兩個蛋白質分子的α-螺鏇之間靠Leu殘基之間的疏水作用力形成一條拉鏈狀結構。這類蛋白與DNA的特異結合都是以二聚體形式起作用的，但與DNA結合的結構域是拉鏈區相鄰的肽鏈N端帶正電荷的鹼性胺基酸區。
螺鏇-環-螺鏇結構模式
（helix-loop-helixmotif，HLH）
HLH這一結構模式廣泛存在於動、植物DNA結
合蛋白中。HLH由40~50個胺基酸組成兩個兩性α螺鏇，兩個α螺鏇中間被一個或幾個β轉角組成的環區所分開。每個α螺鏇由15~16個胺基酸殘基組成，並含有幾個保守的胺基酸殘基。具有疏水面和親水面的兩性α螺鏇有助於二聚體的形成。α螺鏇鄰近的肽鏈N端也有帶正電荷的鹼性胺基酸區與靶DNA大溝結合。具有螺鏇-環-螺鏇結構的蛋白家族成員之間形成同源或異源二聚體是這類蛋白與DNA結合的必要條件，缺失α螺鏇的二聚體不能牢固結合DNA。
HMG框結構模式
（HMG-boxmotif）
在發現一組豐富的高速泳動族蛋白（highmobilitygroupprotein）以後，首先命名HMG框結構模式。該結構由3個α螺鏇組成boomerang-shaped結構模式，具有彎曲DNA的能力。因此，具有HMG框結構的轉錄因子又稱為“構件因子（architecturalfactor）”，它們通過彎曲DNA、促進與鄰近位點相結合的其他轉錄因子的相互作用而激活轉錄。SRY是一種HMG蛋白，在人類男性性別分化中具有關鍵作用，HMG蛋白由Y染色體上一個基因編碼，在誘導睪丸分化途徑中一些相關基因的轉錄活性被HMG蛋白所激活。
功能
1、酶(RNA合成酶、蛋白質磷酸化酶等)；
2、遺傳信息的保持和表達調節(HMG14，HMG17及許多酸性染色體蛋白質)；
3、染色體的結構支持體(matrixprotein，基質蛋白質等；scaffoldprotein，支架蛋白質)等。
