穆勒“五法”的前提是，只存在兩類現象，每類只有三個元素，即a、b、c（現象）和A、B、C（原因），並都先假定了只有一個出現a的條件（原因），②只有A、B、C是可能的條件（原因）。
五法
1、契合法：a與AB一起出現，也與AC一起出現。可知，A是a的充分條件。如，例1：在兩塊麥地上施氮（A），一塊澆水（B），一塊施鈣肥（C），結果產量都增高（a）。則可以猜想施肥（A）是產量增高（a）的原因。
2、差異法：a與ABC一起出現，但不與BC一起出現，可知，A是a的必要條件。如，例2
穆勒“五法”3、契合差異法：a與AB一起出現，也與AC一起出現，但不與BC一起出現。可知，A是a的充分必要條件。如，例在兩塊麥地上施氮肥（A），一塊澆水（B），一塊施鈣肥（C），結果產量都增高（a），而在另一塊麥地上只澆水（B）施鈣肥（C）則產量不變。則可以進一步肯定施肥（A）是產量增高（a）的原因。
4、剩餘法：已知B是b的條件（原因），C是c的條件（原因），abc與ABC一起出現，可知，A是a的充分必要條件。如例4：天文學家觀察出天王星的運行軌道有傾斜現象（a、b、c），已知傾斜現象a、b是受兩顆行星（A、B）的吸引，於是可以猜想還有一顆行星（C）影響天王星的軌道傾斜（c）。
5、共變法：A與a以同樣方式發生變化，而BC則不以這種方式變化。可知，A是a的充分必要條件。如例5：改變單擺的擺長(A)則單擺的周期（a）隨之改變，但改變擺球的質量（B）和擺球的材料（C）則周期不變。則可以認為單擺的擺長(A)決定其周期（a）。
預設條件
通過類似於上面穆勒五法的科學歸納，似乎能夠不太費力地找到事物的因果關係，但事實上非常困難。就穆勒五法而言，最難滿足的就是那兩個預設的條件。
穆勒“五法”第一個稱決定論公設，量子力學和混沌學的出現真實世界中決定論系統並不是太多的，所以並不總能滿足這預設
第二個稱封閉系統公設，這在科學研究中最難滿足的，比如，契合差異法雖然對決定論系統是非常有效的研究方法，但只要系統較為複雜點，其封閉性就很難滿足，對單擺這樣的簡單系統較容易搞清楚某現象（如周期）背後有哪些可能的原因（擺長、質量、材料等），但例3就不簡單。影響麥田產量的可能原因其實有很多很多，因此實際研究決不象例3那樣簡單。
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