生物信息學概論

《生物信息學概論》,作者是奎恩(Krane,D.E.),清華大學出版社2004年出版。本書是為不同學科背景的學生學習生物信息學而精心設計的一本入門教材,目的是使學生掌握生物信息學的基本概念和基礎知識,學習生物學家或計算機科學家考慮問題和解決問題的方法。

基本信息

內容提要

《生物信息學概論》

本書是為不同學科背景的學生學習生物信息學而精心設計的一本入門教材,目的是使學生掌握生物信息學的基本概念和基礎知識,學習生物學家或計算機科學家考慮問題和解決問題的方法。

本書介紹了生物學和計算機套用的基礎知識,提出了許多生物信息學的基本問題,闡述了生物信息學的基本分析方法。此外,本書還給出了許多實用算法和例程。

本書是一本優秀的生物信息學概論或導論教材,可作為生物信息學方向高年級本科生或研究生的入門教材。

作者簡介

孫嘯,男,教授,博士生導師,1962年生。曾經承擔多個國家自然科學金項目、國家863項目以及省部科研項目,主持研製出多個軟體系統。近年來發表論文40多篇。與他人合作出版專著2部,獲得發明專利1項。目前在東南大學生物科學與醫學工程系工作,主要從事生物信息學及基因晶片信息學研究工作。主講過多門課程,早在1999年就開設了“生物信息學”研究生課程。在人才培養方面,致力於工醫複合型人才的培養。曾經獲得江蘇省優秀研究生指導教師、江蘇省優秀碩士學位論文指導教師稱號。

目錄

第1章 分子生物學和生物化學

1.1 遺傳物質

1.2 基因結構和遺傳信息

1.3 蛋白質的結構與功能

1.4 化學鍵的本質

1.5 分子生物學工具

1.6 基因組信息

本章總結

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問題

第2章 資料庫搜尋與兩兩對比

2.1 點陣圖

2.2 簡單比對

2.3 空位

2.4 打分矩陣

2.5 動態規劃:Needleman和Wunsch算法

2.6 全局對比與局部比對

2.7 資料庫搜尋

2.8 多重序列比對

本章總結

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問題

第3章 替換模式

3.1 基因內的替換模式

3.2 估算替換數目

3.3 基因間進化率的變化

3.4 分子時鐘

3.5 細胞器的進化

本章總結

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問題

第4章 基於距離的系統發生分析

4.1 分子系統發生的歷史

4.2 分子系統發生分析的優點

4.3 系統發生樹

4.4距離矩陣

4.5 最大似然法

4.6多重序列比對

本章總結

閱讀資料

問題

第5章 基於特徵的系統發生分析

第6章 基因組學和基本識別

第7章 蛋白質和RNA結構預測

第8章 蛋白質組學

附錄A 計算機編程和數據結構的簡介

附錄B 酶動力學

附錄C PERL程式舉例

辭彙表

部分問題的答案

同名圖書

基本信息

書名:生物信息學概論。

圖書編號:1368047

出版社:第四軍醫大

定價:15.0

ISBN:781086023

作者:王哲

出版日期:2002-02-01

版次: 1

開本:32開

簡介

本書跟蹤生物信息學的最新進展,介紹了這一學科的基本理論、常用生物學資料庫(NCBI/、EBI和GenomeNet)的基本內容和使用方法以及生物信息學在基因級分析、蛋白南組學研究和其他繁瑣哲學這領域研究中的套用。另外,附錄中還列出350餘條分子生物學資料庫網址和內容介紹。可供從事相關專業研究人員參考,也適合於生物醫學類專業本科生和研究生學習使用。

目錄

第一章 概論

第一節 生物信息學及其與生物學的關係

一、生物信息學的定義

二、生物學的發展與生物信息學

三、基因組學、蛋白質組學與生物信息學

四、國內生物信息學現狀及展望

第二節 計算機在生物學及醫學領域的套用

一、生物學、醫學的計算機

二、計算機算法

三、不同類型計算機的功能

四、計算機分析的局限性

五、對更好的計算機工具的需求

六、網路與生物信息學

第二章 生物大分子

第一節 蛋白質的結構與功能

一、蛋白質的結構

1. 胺基酸的結構

2. 肽鍵與肽鏈

3. 蛋白質的構象

二、蛋白質功能

第二節 核酸的結構和功能

一、NDA和RNA的結構

二、遺傳密碼

三、基因與進化

第三章 資料庫和搜尋工具

第一節 計算機工具和資料庫

一、美國國家生物技術信息中心(NCBI)

二、歐洲生物信息學研究所(EBI)

三、日本生物信息學伺服器(GenomeNet)

第二節 資料庫開發工具

一、序列相似性搜尋工具

二、特徵識別工具和資料庫

第四章 基因組分析

第一節 DNA克隆和PCR

一、DNA克隆

二、轉錄譜

三、定點克隆

四、多聚酶鏈式反應(PCR)

五、發展中的測序技術

六、監測測序進展

第二節 DNA序列分析的計算機工具

第三節 基因組分析

第四節 功能基因組

第五節 人類基因組計畫與生物信息學研究

第五章 蛋白質組分析

第六章 生物信息學在生物學中的其它套用

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