分類地位：叢梗孢目是真菌門、半知菌亞門、絲孢綱的一目。
主要科屬：
叢梗孢科
（1）叢梗孢屬 Monilia （2）粉孢屬 Oidium （3）麴黴屬 Aspergillus （4）青黴屬 Penicillium（5）木霉屬 Trichoderma （6）輪枝孢屬 Verticillium （7）葡萄孢屬 Botrytis （8）梨形孢屬 Pyricularia （9）小白尾孢屬 Cercosporella
暗叢梗孢科
（1）黑星孢屬 Fusicladium （2）芽枝孢屬 Cladosporium （3）尾孢屬 Cercospora （4）內臍蠕孢屬 Drechslera (5) 平臍蠕孢屬 Bipolaris （6）突臍蠕孢屬 Exserohilum (7) 彎孢屬 Curvularia （8）鏈格孢屬 Alternaria （9）匍柄霉屬 Stemphyllium
腐質霉屬：分生孢子梗短，常單生，極少數分生孢子梗具有短的分枝，分生孢子梗呈暗色。分生孢子（粉孢子），單生，頂生，球形或亞球形，棕色，單細胞。有些種也會產生單個瓶梗並產生瓶梗孢子，瓶梗孢子呈鏈狀排列。菌落黑色。該屬菌營腐生。在土壤內或病株殘體上越冬，腐生性較強，能在土壤中長期存活。
