基本信息
黃艷新，男，東北師範大學生命科學學院教授、博士生導師。1989年本科畢業於北京理工大學套用數學專業，計算機套用技術專業碩士、博士，細胞生物學專業博士後出站。目前主要從事生物信息學和系統生物學的理論和套用研究，主要研究內容包括抗腫瘤和抗糖尿病藥物分子計算機輔助篩選和實驗驗證，以及基於組學技術和計算系統生物學分析的藥物分子作用機制研究。承擔本科生《生物信息學》課程的教學工作。承擔完成國家、省部和市級科研項目十餘項。在國際、國內重要學術期刊發表論文40餘篇，獲省部級科技進步一等獎一項。
主要學習工作簡歷
主要學習簡歷
1985.9-1989.7 北京理工大學套用數學系套用數學專業 本科生
1996.9-1999.3 長春理工大學計算機學院計算機套用專業 碩士研究生
2001.9-2004.12 吉林大學計算機科學與技術學院計算機套用技術專業 博士研究生
主要工作簡歷
1989.7-1996.8 長春第一汽車製造廠 助理工程師
1993.3-1994.5 日本共和電腦株式會社、日本富士通株式會社 工作、研修
1999.3-2009.4 吉林大學計算機科學與技術學院 講師、副教授
2006.12-2008.12 東北師範大學遺傳與細胞研究所 博士後
2009.4至今 東北師範大學生命科學學院 計算機科學與信息技術學院 副教授、教授
主要研究方向
技術方向：①細胞生物信息學(免疫信息學)和系統生物學；②計算機輔助藥物分子設計。
研究目標：抗腫瘤和抗糖尿病藥物分子篩選及其細胞作用機制研究。
招生意向：招收生物學、生物信息學、理論化學、藥物化學、數學和計算機科學等專業背景，以計算和生物學實驗相結合進行科學研究的碩士、博士研究生（最好能碩博連讀）。同時歡迎其它院校以上學科背景的保送研究生和調劑研究生。
承擔的科研項目
[1]藥物計算與實驗篩選產學研聯盟科技創新攻關平台.長春市科技計畫項目（12ZX55）.2013.12—2015.12.項目負責人(在研).[2]通過基因晶片數據分析與系統生物學建模方法識別誘導癌細胞凋亡藥物靶標.省科技廳自然科學基金項目（20130101148JC）.2013.1—2015.12.項目負責人(在研).
[3]細胞凋亡信號轉導網路多尺度建模及其在新抗腫瘤藥物靶標識別方面的套用研究.國家自然科學基金項目（61172183）.2012.1-2015.12.項目負責人(在研).
[4]基於藥效團和定量構效關係模型的計算機虛擬篩選平台.吉林省中醫藥管理局資助項目(2011-zd16).2011.12—2012.12.項目負責人(結題).
[5]中藥有效成分和藥物分子作用靶標的計算機虛擬篩選.吉林省中醫藥管理局資助項目(2010pt067).2010.12—2011.12.項目負責人(結題).
[6]細胞凋亡信號轉導網路的計算建模研究(20101503)，省科技廳自然科學基金項目，2010.1～2012.12,項目負責人(結題).
[7]基於噬菌體展示庫的B細胞構象性表位預測算法及其套用研究(20080431048)，中國博士後科學基金項目，2006.12～2008.12,項目負責人(結題).
[8]機器味覺識別研究，吉林大學青年教師科研基金，2002.12-2004.12,項目負責人(結題).
主要研究成果
2013年
[1]WangHY,HuangYX*,QiYF,ZhangY,BaoYL,SunLG,ZhengLH,ZhangYW,MaZQ*,LiYX*.MathematicalmodelsfortheNotchandWntsignalingpathwaysandthecrosstalkbetweenthemduringsomitogenesis.TheorBiolMedModel.2013;10(1):27.
[2]YFQi,YXHuang*,HYWang,YZhang,YLBao,LGSun,YWu,CLYu,ZBSong,LHZheng,YSun,GNWang,YXLi*.ElucidatingthecrosstalkmechanismbetweenIFN-gammaandIL-6viamathematicalmodelling.BMCBioinformatics.2013,14(1):41.
[3]WangYC,ZhangYW,ZhengLH,BaoYL,WuY*,YuCL,SunLG,ZhangY,HuangYX,SunY,LiYX*.AnewcompoundfromliquidfermentationbrothofArmillariamelleaandthedeterminationofitsabsoluteconfiguration.JAsianNatProdRes.2013;15(2):203-8.
[4]PPSun,HXJu,ZBLiu,QNing,JZhang,XWZhao,YXHuang,ZQMa*,YXLi*.BioinformaticsResourcesandToolsforConformationalB-CellEpitopePrediction.ComputMathMethodM.vol2013,pp:943636.
[5]ZhangY,BaoYL*,WuY,YuCL,HuangYX,SunY,ZhengLH,LiYX*.AlantolactoneinducesapoptosisinRKOcellsthroughthegenerationofreactiveoxygenspeciesandthemitochondrialpathway.MolMedRep.2013Oct;8(4):967-72.
[6]YJMeng,YWZhang,HYJiang*,YLBao,YWu*,LGSun,CLYu,YXHuang,YXLi*.ChemicalconstituentsfromtherootsofZizyphusjujubaMill.var.spinosa.BIOCHEMSYSTECOL.2013Oct,50:182–186.
[7]NiuTZ,ZhangYW,BaoYL,WuY,YuCL,SunLG,YiJW,HuangYX,LiYX.Avalidatedhigh-performanceliquidchromatographymethodwithdiodearraydetectionforsimultaneousdeterminationofnineflavonoidsinSeneciocannabifoliusLess.JPharmceutBiomedAnal.2013Mar25;76:44-8.
[8]YCWang,YWZhang,LHZheng,YLBao,YWu*,CLYu,YXHuang,LGSun,YZhang,XJJia,YXLi*.FourNewAlkaloidsfromtheFermentationBrothofArmillariamellea.HelveticaChimicaActa.2013Feb,96(2):330.
[9]JHuang*,RatmirDerda,YXHuang.PhageDisplayInformatics.ComputMathMethodM.vol2013,pp:698395.
2012年
[1]CFan,YXHuang*,YLBao*,LGSun,YWu,CLYu,YZhang,ZBSong,LHZheng,YSun,GNWang,YXLi*.VirtualScreeningofSpecificInsulin-LikeGrowthFactor1Receptor(IGF1R)InhibitorsfromtheNationalCancerInstitute(NCI)MolecularDatabase.INTJMOLSCI.2012,13(12),17185-17209.
[2]YXSun,YXHuang*,FLLi,HYWang,CFan,YLBao,LGSun,ZQMa,JKong*,YXLi*.IVSPlat1.0:anintegratedvirtualscreeningplatformwithamoleculargraphicalinterface.CHEMCENTJ.2012,6:2.
[3]WHChen,WWGuo,YXHuang*,ZQMa*.PepMapper:ACollaborativeWebToolforMappingEpitopesfromAffinity-SelectedPeptides.PLoSONE2012,7(5):e37869.
[4]XWZhao,JKLi,YXHuang*,ZQMa*,MHYin*.PredictionofBioluminescentProteinsUsingAutoCovarianceTransformationofEvolutionalProfiles.INTJMOLSCI.2012,13(3),3650-3660.
[5]YangXG,BaoYL*,HuangYX,SunLG,ZhangYW,YuCL,WuY,LiYX*.6-[(1-naphthylmethyl)sulfanyl]-9H-purineinducesG2/MphasearrestandapoptosisinhumanhepatocellularcarcinomaHepG2cells.EurJPharmacol.2012Nov15;695(1-3):27-33.
[6]YYLi,YLBao*,ZBSong,LGSun,PWu,YZhang,CFan,YXHuang,YWu,CLYu,YSun,LHZheng,GNWang,YXLi*.TheThreonineProteaseActivityofTestes-SpecificProtease50(TSP50)IsEssentialforItsFunctioninCellProliferation.PLoSONE2012,7(5):e35030.
[7]ZLCao,JZMeng,XXLi,RPWu,YXHuang,YXHe*.TheEpitopeandNeutralizationMechanismofAVFluIgG01,aBroad-ReactiveHumanMonoclonalAntibodyagainstH5N1InfluenzaVirus.PLoSONE2012,7(5):e38126.
[8]MZheng,JNWu,YXHuang,GXLiu,YZhou*,CGZhou.InferringGeneRegulatoryNetworksbySingularValueDecompositionandGravitationFieldAlgorithm.PLoSONE2012,7(12):e51141.
[9]MZheng,YXHuang,WShen,YZhong,JNWu,GXLiu*,YZhou*.Anovelscale-freenetworkconstructionmethodanditsapplicationingeneexpressionprofilessimulation.PROGBIOCHEMBIOPHYS.2012,39(6):581-590.
[10]YWZhang,HLin,YLBao,YWu,CLYu,YXHuang,YXLi*.AnewtriterpenoidandotherconstituentsfromthestembarkofJuglansmandshurica.BIOCHEMSYSTECOL2012,44,136-140.
2011年
[1]PPSun,WHChen,YXHuang*,HYWang,ZQMa*,YHLv*.Epitopepredictionbasedonrandompeptidelibraryscreening:Benchmarkdatasetsandpredictiontoolsevaluation.Molecules2011;16(6):4971-4993.
[2]WHChen,PPSun,YLu,WWGuo,YXHuang*,ZQMa*.MimoPro.amoreefficientWeb-basedtoolforepitopepredictionusingphagedisplaylibraries.BMCBioinformatics2011;12:199.
[3]ZBSong,YLBao*,YZhang,XGMi,PWu,YWu,CLYu,YSun,LHZheng,YXHuang,BLiu,YXLi*.Testes-specificprotease50(TSP50)promotescellproliferationthroughtheactivationoftheNF-kappabeta(NF-κB)signalingpathway.BiochemJ.2011;436(2):457-467.
[4]YShi,YLBao*,YWu*,CLYu,YXHuang,YSun,LHZheng,YXLi.AlantolactoneInhibitsCellProliferationbyInterruptingtheInteractionbetweenCripto-1andActivinReceptorTypeIIAinActivinSignalingPathway.JournalofBiomolecularScreening.2011;16(5):525-535.
[5]HLin,YWZhang,LHZheng,XYMeng*,YLBao,YWu,CLYu,YXHuang,andYXLi*.AnthraceneandAnthraquinoneDerivativesfromtheStemBarkofJuglansmandshuricaMaxim.HelveticaChimicaActa,2011;94(8):1488-1495.
2010年
[1]YZhang,YLBao*,MTYang,YWu,CLYu,YXHuang,YSun,LHZheng,YXLi*.ActivinAinducesSLC5A8expressionthroughtheSmad3signalingpathwayinhumancoloncancerRKOcells.IntJBiochemCellBiol,2010,42:1964–1972.
[2]MWang,YLBao*,YWu,CLYu,XYMeng,YXHuang,YSun,LHZheng,YXLi*.BasicFGFDownregulatesTSP50ExpressionviatheERK/Sp1Pathway.JournalofCellularBiochemistry.2010,111:75-81.
[3]YZhang,LZhou,YLBao*,YWu,CLYu,YXHuang,YSun,LHZheng,YXLi*.ButyrateinducescellapoptosisthroughactivationofJNKMAPkinasepathwayinhumancoloncancerRKOcells.Chem.Biol.Interact.2010,185:174-181.
[4]LZhou,YLBao*,YZhang,YWu,CLYu,YXHuang,YSun,LHZhengandYXLi*.KnockdownofTSP50inhibitscellproliferationandinducesapoptosisinP19cells.IUBMBLife.2010Nov;62(11):825-832.
2009年
[1]ZBSong,YLBao*,YWu,CLYu,YXHuang,YXLi.Testes-SpecificProtease50PromotesTumorigenesisthroughActivationofNF-kBSignalingPathway.21stIUBMB&12thFAOBMBInternationalCongressofBiochemistryandMolecularBiology.2009,8:59.
2008年
[1]YXHuang,YLBao*,SYGuo,YWang,CGZhou,YXLi*.Pep-3D-Search:amethodforB-cellepitopepredictionbasedonmimotopeanalysis.BMCBioinformatics,2008,9:538.
[2]黃艷新,鮑永利*,李玉新*.抗原表位預測的免疫信息學方法研究進展.中國免疫學雜誌,2008,Vol24,No9,pp857-861.
[3]SXZou,YXHuang,YWang,CGZhou*.ANovelMethodforPredictionofProteinDomainUsingDistance-BasedMaximalEntropy.JournalofBionicEngineering2008,Vol.05,No.03,pp215-223.
2007年
[1]YWang,XYFeng,YXHuang,DBPu,WGZhou,YCLiangandCGZhou*.anovelquantumswarmevolutionaryalgorithmanditsapplications.Neuro-computing,volume70(issues4-6),January2007,pp:633-640.
2006年
[1]YXHuang,CGZhou,YWang,YLBao,YWu,YXLi*.Ahybridalgorithmforsolvinggeneralizedclasscoverproblem.The2ndInternationalConferenceonNaturalComputation(ICNC),Xi’anChina,Proceedings,Sep.2006,PartsI,pp610-619.
[2]SXZou,YXHuang,YWang,CGZhou*.Predictionofproteindomainsfromsequenceinformationusingsupportvectormachines.ThirdInternationalSymposiumonNeuralNetworks(ISNN2006),Proceedings-PartIII,2006,pp674-681.
[3]王岩,路春一,豐小月,黃艷新,鄒淑雪,周春光*.一種新的量子群進化算法研究.小型微型計算機系統,2006,Vol.27,No.8,pp1478-1482.
[4]鄒淑雪,王岩,周春光*,黃艷新.一種基於支持向量機的模糊分類系統研究.小型微型計算機系統,2006,Vol.27,No.4,pp701-705.
2005年
[1]YXHuang,CGZhou*.RecognizingTasteSignalsUsingAClustering-basedFuzzyNeuralNetwork.ChineseJournalofElectronics,Jan.2005.Vol.14,No.1,pp21-25.
[2]YXHuang,YWang,WGZhou,ZZYu,CGZhou*.AFuzzyNeuralNetworkSystemBasedonGeneralizedClassCoverandParticleSwarmOptimization.2005InternationalConferenceonNaturalComputation(ICNC),Hefei,China,2005:119-128.
[3]YWang,XYFeng,YXHuang,WGZhou,YCLiangandCGZhou*.ANovelQuantumSwarmEvolutionaryAlgorithmforSolving0-1KnapsackProblem.AdvancesinNaturalComputation,FirstInternationalConference(ICNC2005),Chang-Sha,China,Vol.3611,2005:698-705.
[4]GXLiu,YXZhu,WGZhou,YXHuang,CGZhou*,RXWang.AStudyonProteinResidueContactsPredictionbyRecurrentNeuralNetwork.JournalofBionicsEngineering.Sep.2005,Vol.2,No.3,pp157-160.
[5]黃艷新,周春光*,鄒淑雪,王岩.一種求解類覆蓋問題的混合算法.軟體學報,2005,Vol.16,No.4,pp513-522.
[6]王岩,周春光*,黃艷新,豐小月.基於最小不確定性神經網路的茶味覺信號識別.計算機研究與發展,2005,Vol.42,No.1,pp66-71.
2004年
[1]YXHuang,YWang,CGZhou*,SXZou,XWYangandYCLiang.ReductionandOptimizationForASupport-Vector-Machine-BasedFuzzy-Classification-System.ProceedingsoftheThirdInternationalConferenceonMachineLearningandCybernetics,Shang-Hai,China,26-29August,2004,pp3402-3407.
[2]YXHuang,CGZhou*,SXZou,YWangandYCLiang.ARough-Set-BasedFuzzy-Neural-NetworkSystemForTasteSignalIdentification.2004InternationalSymposiumonNeuralNetworksProceedings(PartII),Da-Lian,China,19-21,August,2004,pp337-343.
[3]YWang,CGZhou*,YXHuang,XYFeng.TrainingMinimalUncertaintyneuralNetworksbyBayesianTheoremandParticleSwarmOptimization.11ThInternationalConferenceonNeuralInformationProcessing,Nov.2004,Calcutta,India,pp579-584.
[4]YWang,CGZhou*,YXHuang,YCLiangandXWYang.ABoundaryMethodtoSpeedupTrainingSupportVectorMachines.TheInternationalconferenceonComputationalmethods(ICCM2004),NationalUniversityofSingapore,dec.2004,PartII,pp1209-1213.
[5]黃艷新,周春光*,鄒淑雪,王岩.一種基於類覆蓋和粒子群最佳化的模糊神經網路系統.計算機研究與發展,2004,Vol.41,No.7,pp1053-1061.
[6]黃艷新,周春光*,楊國慧,鄒淑雪.基於熵聚類模糊神經網路味覺信號識別的研究.計算機研究與發展,2004,Vol41,No.3,pp414-419.
獲獎情況
(1)參加完成科研項目“智慧型計算建模及套用研究”，並作為主要完成人之一獲得吉林省科學技術進步一等獎（獲獎時間：2007年12月）。
(2)博士論文“計算機味覺信號識別的研究”被評為吉林大學2007年優秀博士學位論文二等獎（獲獎時間：2007年11月）。
