劇情簡介
決鬥者王國篇
遊戲王DM戰鬥城市前篇
決鬥者王國一戰結束，武藤遊戲的知名度瞬間上升，神秘的埃及石板來到日本展覽，牽扯出千年神器的秘密、三千年前的戰鬥、三張神之卡，還有隱藏在千年積木中的無名法老王的記憶，海馬瀨人在一個機緣下得到了神之卡的其中一張：歐貝利斯克的巨神兵，而他為了得到剩餘的二張神之卡，在童實野市舉辦了決鬥城市大賽，並且以賭牌當作規則，同時新的次世代決鬥盤也跟著亮相，而武藤遊戲為了尋找心中的另一個自己的記憶，也就是無名法老王的記憶，必須蒐集三張神之卡，也參加了這場大賽，各路好手為了蒐集六張拼圖卡，得到最後的參賽權，紛紛展開決鬥；神秘的古魯斯集團派出的稀有卡獵人也參雜其中。
乃亞篇
戰鬥飛行船行駛人工島的途中，飛行船系統卻遭受到外來的入侵改寫了系統，因而改變了航線，阻擋在武藤遊戲等人面前的這個巨大機動要塞究竟是什麼？而之前被遊戲等人打敗的“五巨頭”，為了搶奪遊戲等人的身體而將他們拉入虛擬世界展開決鬥，決鬥中，他們發現五大老身後隱藏的名叫乃亞的小孩，卻是海馬的養父海馬剛三郎的兒子！！一場大戰即將展開。
戰鬥城市後篇
戰鬥城市最終決戰開始，每個決鬥者都各自有戰鬥的理由，城之內為了成為真正的決鬥者、救出被馬利克進行黑暗遊戲懲罰的孔雀舞，海馬為了與宿敵遊戲決鬥、為了剷除可惡的古魯斯首腦並得到太陽神、為了完成海馬樂園的夢想，遊戲為了實現與城之內的諾言、與海馬宿命的對決、救出被暗馬利克施予黑暗遊戲懲罰的人們、更為了自己遺失的記憶，他向馬利克宣戰。
多瑪篇
戰鬥城市結束後，武藤遊戲遭受到了不知名力量的阻擋，而三張神之卡也被名為多瑪三劍客的人搶走，這個神秘的多瑪組織搶走神之卡的目的究竟是什麼，神秘的卡片——“奧利哈剛的結界”擁有的黑暗能量，又會帶給使用這張卡片的人什麼樣的改變；黑魔導女孩從精靈的世界降臨，向武藤遊戲請求援助，人類世界與精靈世界的命運會如何，無名的傳說之龍又會怎么樣的幫助遊戲等人。
海馬集團大賽篇
多瑪事件結束後，武藤遊戲和同伴因沒錢回不到日本，無奈之下請求海馬公司，卻陰差陽錯的參加了海馬集團為維護聲譽的比賽。全世界的決鬥者聚集在這，一場別開生面的比賽就此展開。
王之記憶篇
為了尋找寄宿在千年積木中無名法老王靈魂的真實姓名與記憶，武藤遊戲與朋友們踏上了埃及之旅，在記憶石板的背後，解開了無名法老王的過去記憶，暗貘良也趁此時蠢蠢欲動，利用了千年智慧輪的黑暗力量，在千年積木內進行了一場黑暗RPG，這場黑暗RPG遊戲中，直接以無名法老王的記憶當作背景，暗遊戲必須從這場黑暗遊戲中找回自己的真實姓名、得知自己的過去，並且打敗大邪神佐克，再一次封印，否則大邪神佐克也會在現實世界中復活。
角色簡介
主要人物
武藤遊戲
聲優：風間俊介
王牌：黑魔術師、黑魔導女孩、歐貝里斯克的巨神兵、歐西里斯的天空龍、太陽神的翼神龍
偉大的古埃及法老王，三神是他的守護神。三千年前，為了對抗大邪神佐克拯救人類，他選擇犧牲自己的生命和靈魂，把大邪神佐克封印到冥界，同時也把自己的靈魂封印到千年積木中。經過三千年痛苦的煎熬，法老王的靈魂被武藤遊戲解放，由此命運的齒輪再次運轉。在現代社會，最初他懲治邪惡的時候並未打算讓表遊戲察覺他，但是最終還是被發現了。在夥伴的溫柔和包容中，他和表遊戲結成了摯深的友誼。從原本的黑暗與孤獨中脫離。後來認識到海馬瀨人，與城之內克也等結下了友情的羈絆。他參加了決鬥王國的大賽打敗貝卡斯得到冠軍，之後的決鬥城市比賽當中先擊敗了表馬利克得到了歐西里斯的天空龍，隨後在準決賽當中勝擊敗了宿敵海馬瀨人，獲得了歐貝里斯克的巨神兵，最後在總決賽當中打敗了暗馬利克得到了太陽神的翼神龍，獲得了"決鬥王"的稱號，，他解開了被封印的記憶，暗貘良利用了千年智慧輪的黑暗力量，在記憶石板內進行了一場終極黑暗RPG並且成功讓大邪神佐克在記憶世界裡復活，法老王僅憑三幻神的力量，也無法擊敗最後的敵人——大邪神佐克。在同伴的幫助下，法老王奪回了自己的「真實之名」，將三幻神合體成為「光之創造神--哈拉克提」，一招將黑暗大邪神佐克內洛法徹底消滅。最終他的靈魂去了該去的地方，故事也隨之在光明之中完結。
武藤遊戲
聲優：風間俊介
王牌：沉默劍士、沉默魔術師、破壞龍甘多拉
本是一名普通的中學生，非常喜歡玩遊戲。由於身材矮小，在學校常受人欺負。在花八年的時間拼成了千年積木後，他的心中出現了另一個自己（暗遊戲），並憑著自己的真誠與善良交到了知心的朋友。後來通過參加決鬥王國和戰鬥城市卡片決鬥大賽並獲得勝利，奠定了史上最強決鬥者的稱號。
海馬瀨人
聲優：津田健次郎
王牌：青眼白龍、青眼究極龍、歐貝里斯克的巨神兵、XYZ-神龍炮
海馬娛樂集團董事長、決鬥虛擬影像系統的發明者、決鬥學院的創始人。僅次於武藤遊戲的傳說級決鬥者，以壓倒性的力量和戰術擊敗對方！舉辦了決鬥城市及KC大賽這樣的大型賽事。三千年前神官塞特的轉世。性格孤傲，自尊心極強。只有弟弟一個親人。將遊戲視為其最大的對手，但同時和他也有很深的羈絆。不相信那些超自然的事物。
城之內克也
聲優：高橋廣樹
王牌：真紅眼黑龍、閃電之戰士吉爾福德
遊戲最好的朋友。性格單純，但有著一顆善良、勇敢的心。非常關心妹妹靜香，為了籌措她的手術費去參加決鬥王國，之後他立志成為真正的決鬥者而和遊戲一起參加各項比賽。一開始技術並不好，但有著驚人的強運，之後慢慢成長，最後成為被貝卡斯認同的僅次於武藤遊戲和海馬瀨人的世界第三決鬥者。
真崎杏子
聲優：齋藤真紀
童實野高中二年級學生，遊戲的青梅竹馬。個性勇敢，善良，意志堅定，不服輸，有一點火爆，相信友情的力量。畢業後想前往紐約，成為職業舞者。經常和遊戲一起行動，暗戀暗遊戲卻不敢說出口，最後只能默默目送暗遊戲的離去。
本田廣
聲優：近藤孝行（前期）菊池英博（後期）
遊戲與城之內的好友，和城之內一樣的武鬥派。在王之記憶篇中和城之內、杏子一起進入暗遊戲的世界去幫助他。喜歡川井靜香。
貘良了
聲優：井上瑤（DM決鬥王國篇）松本梨香（DM後期）
遊戲的同學。自從父親送給貘良了他從埃及帶回的千年智慧輪後，大邪神佐克的部分靈魂便寄宿於這個少年的身上成為貘良了的邪惡人格。
暗貘良
聲優：井上瑤（DM決鬥王國篇）松本梨香（DM後期）
真正身份：黑暗大邪神（佐克·內洛發）
侵占表貘良身體的邪惡人格，也是記憶篇裡面黑暗大邪神佐克的一部分靈魂，他的目的是收集七個千年神物，開啟黑暗之門，復活自己的本體（黑暗大邪神佐克·內洛法）。他長期潛伏在遊戲的身邊，直至埃及篇暗遊戲用三張神之卡打開了記憶世界大門，暗貘良利用了千年智慧輪的黑暗力量，在記憶石板內進行了一場黑暗RPG，這場黑暗RPG遊戲中，直接以無名法老王的記憶當作背景，以暗貘良（千年輪上的靈魂）與暗遊戲（千年積木的靈魂）作為RPG遊戲的雙方玩家，其後暗貘良利用停止時間沙漏的作用成功復活自己的本體（黑暗大邪神佐克·內洛法），然後進入大邪神佐克的身體內進行靈魂融合成為完全的邪神，最後被光之創造神徹底消滅。
其他人物
海馬圭平
聲優：竹內順子
海馬瀨人的弟弟。海馬娛樂集團的二把手。雖然還只是個小學生，卻擺出一副小大人的樣子。黑色長髮，給人非常可靠的感覺。性格溫柔又富有正義感。非常尊敬和信賴哥哥。
御伽龍兒
聲優：內藤玲
DDM遊戲的創始人，擁有超凡的智慧和頭腦，由於遊戲打敗貝卡斯導致DDM不能被開發，恨上了遊戲，但是經過對戰，發現自己的錯誤，與遊戲一行人成為好朋友。喜歡川井靜香。
武藤雙六
聲優：宮澤正
龜記遊戲屋店長，遊戲的爺爺。古埃及第十七代法老王的守護神官、第十八代法老王的貼身侍官、第一任千年鑰匙的擁有者——西蒙的轉世。
家裡開遊戲店，店裡有從各國來的許多遊戲卡。一次考古中發現了千年積木。據說他以前曾經是個站在遊戲界頂端、最厲害的人物。
川井靜香
聲優：鮭延未可
城之內克也的親妹妹（兩親離婚，撫養權歸屬之故，所以與城之內的姓不同）。由於眼疾住院，使用決鬥者王國的優勝獎金支付手術費用後康復。御伽龍兒和本田廣對她抱持著好感，不過她本人卻完全沒感覺到。是個善良勇敢的女孩。
守墓一族
馬利克·伊修達爾
聲優：岩永哲哉
王牌：歐西里斯的天空龍、太陽神的翼神龍
守墓一族的後裔，自幼就被禁止跟外界有任何接觸，並且被迫接受痛苦的刻印儀式。因偷偷外出被父親發現的馬利克在利希德倒下時讓黑暗人格初次醒來；恢復意識的馬利克以為害死他父親的是法老王，因此率領『古魯斯』偷取神之卡，並且多次想殺死遊戲，直到伊西絲對遊戲他們說出真相，才發現害死自己父親的是自己的黑暗人格。
暗馬利克
由馬利克的悲傷.怨恨之心而誕生出的另一個人格，想破壞世上一切；是個會將對手摺磨致死的殘酷人格，也是之前慘劇的真正兇手。顏藝始祖。由於比馬利克多接受了真實的千年錫杖啟示，因此能夠比馬利克更加了解太陽的翼神龍的其他特殊能力。隨著馬利克的意識逐漸消失，暗馬利克也逐漸安定在肉體裡面；甚至即使利希德恢復意識也不會再被壓抑，不過在馬利克因利希德的勸說下恢復了對於生存的意念；再度將人格成功交換，並以投降的方式將暗人格完全消滅。
伊西絲·伊修達爾
聲優：島本須美
王牌：現世與冥界的逆轉
馬利克·伊修達爾的姐姐,也是埃及政府重要的人物,是為了童實野市的美術館的舉辦從埃及而來的.是她驅使海馬瀨人舉辦決鬥都市,為了救弟弟馬利克,也下場決鬥.但輸給了海馬,所以她將救弟弟的希望寄托在了暗遊戲身上。
利希德
聲優：KONTA
王牌：聖獸塞勒凱特
馬利克的義兄，封印暗馬利克的關鍵人物。
夏迪
聲優：佐佐木望
《遊戲王》中最神秘的一個人物。一般認為他是守護法老王的石板精靈哈珊的化身，總是在最重要的時候突然出現。根據原作設定，守墓一族在3000年的過程中分裂成了2派，夏迪那群人的守墓血族派，和隱居的伊修達爾家族。夏迪一方的守墓派的任務，就是守護千年神器等待千年神器之謎解開。夏迪的任務是完成無名的法老王的靈魂歸還.,以及保護千年神器的石板和神器。在最後夏迪的靈魂進入石板精靈哈珊的體內擋下了黑暗大邪神佐克的致命一擊，靈魂灰飛煙滅。
職業決鬥者
貝卡斯·J·克羅佛多
聲優：高杉JAY二郎
王牌：卡通世界
原為一名畫家，因戀人之死而到埃及尋找復生方法，卻在埃及意外得到千年眼。後發明“決鬥怪獸”卡片遊戲，創立國際幻像社。牌組主力為卡通世界。在決鬥王國杯被武藤遊戲打敗之前無人能敵，輸給武藤遊戲後被暗貘良襲擊並挖走千年眼（與動畫不同，漫畫中被殺死並奪走千年眼）。是動畫前期主要敵人。後期在“多瑪”篇出現，當時他已不在決鬥王國島，而是在美國的幻象公司，被達茲一行人封印靈魂，用來使奧利哈剛之神復活毀滅世界，後被武藤遊戲救出。
孔雀舞
聲優：寺田春日
王牌：神鷹女郎三姐妹
使用神鷹女郎和亞馬遜系列的女決鬥者，技術相當高明，在大多數的比賽中都有留名。對於貪圖她美貌的男人都很不留情面,平常卻是個愛照顧人的大姐姐。渴望變強，並喜歡著城之內。
基斯·霍華德
聲優：駒田初
王牌：左輪手槍龍
前全美冠軍。為了獲勝不擇手段。因輸給貝卡斯而對他懷恨在心，想在決鬥者王國比賽中對他復仇。
昆蟲羽蛾
聲優：高乃麗
王牌：大飛蛾、昆蟲女王
日本全國大賽冠軍。性格卑鄙無恥，為了獲勝不擇手段。在動畫中屢戰屢敗。使用昆蟲卡組。
恐龍龍崎
聲優：藤井欣（前期）中村悠一（後期）
王牌：暗黑恐龍、暴君龍
西日本代表，日本全國大賽亞軍。在決鬥者王國初戰中被城之內打敗而失去了真紅眼黑龍，對城之內便抱著強烈的復仇心。與羽蛾經常一起行動。使用恐龍卡組。
梶木漁太
聲優：浪川大輔
王牌：傳說的漁人、要塞鯨魚
日本全國大會第三名，為了買一艘漁船而參加比賽，之後敗給遊戲，兩人成為朋友。在戰鬥城市篇再度登場，輸給城之內。
鬼骨冢
聲優：鈴木真仁
王牌：南瓜幽靈王、金色的魔象
實力非常弱的決鬥者，外貌與鬼魂相似。在決鬥者王國篇中，與佐竹、高井戶清等人一起跟隨基斯·霍華德，敗給城之內克也後應基斯要求將武藤遊戲等人困在迷宮中，沒想到卻被基斯毆打，金屬星星也被奪走；而在戰鬥城市篇則輸給暗貘良。
超能絽場
聲優：伊藤舞子
王牌：人造人電子機器人
自稱有超能力的決鬥者，不過事實上是以他的弟弟們在遠處以望遠鏡窺視對手手牌，再以暗號傳遞訊息。被城之內識破於對戰城之內落敗。
潘多拉
聲優：子安武人
王牌：黑魔術師
古魯斯組織里的魔術師決鬥者，他的面具下有著很嚴重的傷痕。向遊戲挑戰，最後被暗遊戲擊敗。
王之記憶篇人物
塞特
聲優：津田健次郎
海馬瀨人的前世。古埃及六大神官之一，擁有千年錫杖。幼年無父，母親一人將他養大，後來因資質過人，成功加入神官團。在學習期間經常受到其父阿克納帝神官的幫助，不過當時他並不知道阿克納帝是他的父親。主戰精靈是迪歐斯，絕招為念波動劍。在TV版中幼時救過琪莎拉，作為代價所生活的村莊被強盜焚毀。在琪莎拉被黑暗大神官（其父親阿克納帝神官）殺死後其精靈——可以與神媲美的青眼白龍成為了他永遠的僕人。性格高傲。曾經與法老王阿圖姆對立，後成功取得王位。是阿圖姆的堂哥。
阿克納帝
聲優：上別府仁資、石井康嗣
古埃及六大神官之一，擁有千年眼。前代法老王的弟弟,塞特的父親。原本是一位溫和的長者，但受到暗貘良的蠱惑，為了讓兒子成為新法老王將靈魂出賣給大邪神，成為了黑暗大神官。殺害琪莎拉後，被塞特所殺。
琪莎拉
聲優：中川里江
謎一般的女子，擁有一頭白髮,一雙藍眼睛和白色的皮膚。小時候被塞特救過。擁有可與神的力量比肩的精靈青眼白龍。因而被阿克納帝所抓想要將那份力量變成塞特的。最後為救塞特被阿克納帝所殺。
馬哈德
聲優：小嶋一成
古埃及六大神官之一，擁有千年智慧輪。他是王城戒備隊長，負責古埃及的治安和安全。馬哈德是一個很忠誠的神官，對暗遊戲（法老王）絕對忠誠。小時候，保護法老王不被蛇咬而記住了法老王的實現平等和平的願望。從此盡力幫助法老王。在與暗貘良的激戰中，不敵對手，最後使出禁術，自己結束自己的生命，讓自己的靈魂與自幻想魔術師融合，成為‘黑魔導’。從此時刻伴隨王左右。
瑪娜
聲優：中尾友紀
馬哈德的弟子，操縱的精靈是黑魔導女孩。是法老王的青梅竹馬。在阿圖姆打敗大邪神佐克和阿克納帝後繼承師父成為了使用千年智慧輪的神官。
艾西斯
聲優：島本須美
古埃及六大神官之一，擁有千年首飾。
夏達
聲優：佐佐木望
古埃及六大神官之一，擁有千年鑰匙。
卡利姆
聲優：川中子雅人
古埃及六大神官之一，擁有千年秤。
盜賊王巴庫拉
聲優：松本梨香
召喚精靈：精靈獸·迪亞邦多
克雷艾爾那村大屠殺下的倖存者，亦是表貘良的前生。在前期及中期劇情的盜賊王一心一意只想為死去的村民報仇，並經常提起對於克雷‧艾爾那村大屠殺的怨恨，但在劇情後期的盜賊王逐漸產生了「將一切事物都破壞」的想法。精靈獸一度打敗馬哈德，搶到千年智慧輪後吸收了千年輪上的邪念之後，成長為精靈超獸。但在亞圖姆與祭司們的攻擊下，精靈超獸被消滅之後，身體化為砂子消失。
黑暗大邪神佐克·內洛法
聲優：海津義孝
通過將七件千年神器嵌入石板而復活的大邪神，是冥界的黑暗邪神，統率無數死靈軍團，其力量來自於世間存在的黑暗，即只要有黑暗存在，邪神的力量就會源源不斷地產生，象徵著無窮無盡的黑暗，其攻擊力無限，防禦力無限，身體可再生，也是暗貘良的真正身份。原本沉睡在冥界，阿古納帝鑄造七神器後，他被喚醒了，但阿古納帝沒將神器嵌入石板讓他復活，此時它將一小部份的靈魂封印在千年輪上面，三千年後千年輪落入貘良了手上，邪念便附身在貘良了的身上形成了暗貘良。在埃及篇，暗貘良成功復活讓大邪神佐克在記憶世界復活，並且進入大邪神佐克身體裡面進行靈魂融合成為完全的邪神，最後法老王阿圖姆以自己的名義把三幻神結合召喚的光之創造神哈拉克提一招將黑暗大邪神佐克·內洛法徹底消滅。
動畫原創人物
蕾貝卡·霍普金斯
聲優:たがみかおり
年僅12歲就獲得了全美決鬥冠軍並上了大學的天才決鬥少女。武藤雙六好友亞瑟·霍普金斯教授的孫女。和表遊戲決鬥後喜歡上了表遊戲並稱呼他為Darling。 使用的是自閉向削血卡組。喜歡泰迪熊，有著很高的計算機技術，可以輕鬆破解海馬公司保衛系統的密碼。
海馬乃亞
聲優：橫山智佐
王牌：天界王志那都
海馬剛三郎的親生兒子。長得很像朝日版的海馬瀨人，有一頭綠色的頭髮。不過由於小時候的意外，使他只能在虛擬世界裡存活。在乃亞篇里，乃亞利用了海底的巨大要塞將決鬥艇帶到海中。並且還展開了決鬥，想要擊垮海馬瀨人。而且乃亞還給圭平洗腦，用圭平刺激海馬讓他無法行動。最後為了木馬而搭救海馬等人回到了現實世界。
達姿
聲優：繪麻緒由
王牌：蛇神彝
一萬年前亞特蘭蒂斯的王，操縱奧利哈剛之力。曾經因為看到充滿了心靈黑暗面的現世，受地球核心黑暗之神的命令，摧毀了亞特蘭蒂斯文明，此後與神共存，如今人類內心的黑暗又一次蠢蠢欲動，於是決心再次毀滅這個世界。建立多瑪組織，參與策劃了許多歷史事件。使用奧利哈剛卡組。
拉菲魯
聲優：川原慶久
王牌：守護者·艾托斯
多瑪三劍客之一。海浪之中失去所有家人，獨自一人在孤島上過上多年生活的“魯濱遜”。曾打敗過主角武藤遊戲。被暗遊戲稱為“真正的決鬥者”。使用守護者卡組。
亞美魯達
聲優：家村幸成
多瑪三劍客之一。憎恨戰爭，痛恨販賣軍火的海馬集團。因弟弟死於海馬公司的軍火武器手下，決心向海馬復仇，後被證實是達姿所害。使用機械卡組。
巴龍
聲優：前田剛
多瑪三劍客之一。幼時是個孤兒，育幼院被達姿所燒後被達姿選中。性格自由奔放，喜歡孔雀舞。使用盔甲卡組。
奇古羅伊德
聲優：津田英佑
沒落的家族企業繼承人，想要通過KC大獎賽打倒擠垮了自己家的海馬公司。使用北歐神話女神卡組。
雷恩·哈爾特
聲優：野口聖古
奇古羅伊德的弟弟，非常喜歡戰鬥怪獸卡和童話故事，在KC大獎賽與遊戲決鬥，使用童話卡組。
製作人員
原作：高橋和希
導演：杉島邦久
主要編劇：武上純希（決鬥王國篇-乃亞篇）、前川淳（戰鬥城市後篇）、吉田伸（多瑪篇、王之記憶篇）、面出明美（海馬集團大賽篇）、彥久保雅博（決鬥編劇）
劇場版
《遊戲王劇場版-光之金字塔》（2004年上映）
《遊戲王：～超融合！跨越時空的羈絆～》（2010年上映）
《遊戲王：THEDARKSIDEOFDIMENSIONS》（2016年上映）
