光緒四年（1878）授查地委員，奉吉林將軍命，率隨員一行、兵丁500至阿克敦城地方勘察土地。時阿克敦城榛蕪未刪，多有盜賊。他一面招集地戶開墾，許以建城設官；一面派兵清剿，保衛地方。墾戶恃以無恐，方始紛至沓來。荒務局設於江東葦子溝（今江東村）。拓荒伊始，墾農多無力置地，他因勢利導，斷然變通科賦，實行優惠政策，引進吉林大戶遷敦墾殖。設治後頒布“三七升科賦辦法”（開十餉，升科七垧），四方地戶雲集，至光緒十一年（1885）放荒2.3萬垧。
光緒六年奏準阿克敦城設知縣一員，巡檢、訓導、外委各一員。趙敦諴於光緒七年首任知縣，始監造城郭，光緒八年竣工。城築土為牆，頂復厚木板，磚砌垛口。城周長5里，城門5座。每座城門樓上有敦諴親題城門名於門額上。東門曰迎旭，南門曰來熏，西門曰邑爽，小西門曰德勝，北門曰棋辰，四周護城河深1丈。
趙敦諴精於武備，匪蹤日少。自光緒五年至十年，辦匪盜案12起，人犯20起。斷案公正，民皆悅服。他熱心教育，放荒時即設“教諭”，劃出“學田地”，辦書塾，立縣試，造就人才。
敦化地方病（克山病）流行頗盛，百姓多興跳神治病，他常傳巫神問罪於大堂，破迷信，倡國醫，救民於災疫。
光緒十六年（1890）以政績遷雙城廳通判。光緒二十七年（1901）復任敦化知縣。趙敦諴兩度任敦化知縣，政績昭著，深受百姓愛戴，稱其為“趙大老爺”。離任時，百姓將其官靴留下，懸於城門樓上，以示其德政。
光緒二十九年（1903）趙敦諴病逝，浮厝於城隍廟後院。1936年由其長孫媳李桂馨護靈柩經圖們、朝鮮清津港渡歸籍，安葬於山東萊陽視家樓陵園。
