現設有綜合科、教學管理科、學生管理科（團總支）、12個教研室、1個基礎醫學實驗教學中心和9個研究所（室）。目前法醫學專業隸屬基礎醫學與法醫學院管理。
現有教職工171人，其中，教授21人，副教授37人，講師70人；高級實驗師11人；博士10人，碩士74人；享受國務院特殊津貼2人，全國勞模1人，全國優秀教師1人，省級教學名師4人，校級教學名師3人，濟寧市科技功臣1人。
現有1個省級重點學科、4個校級重點學科（實驗室），1個省級實驗教學示範中心。共有1門國家級精品課程，2個省級教學團隊、3個校級教學團隊,4門省級精品課程、2門省級成人高等教育特色課程、6門校級精品課程和2門校級優質課程。
承擔著全校臨床醫學、預防醫學、口腔醫學、醫學影像學、法醫學、護理學、醫學檢驗、康復治療學、套用心理學等專業醫學基礎課程的教學任務。近五年來在國內外學術期期刊發表論文500餘篇，出版著作40餘部，承擔省級以上課題30餘項。
學院將以科學發展觀為指導，以教學質量為中心，加強內涵建設，全面提高教育教學質量，努力建設成為教學水平高、綜合科研實力強、專業特色鮮明的二級學院。
