腹部外科是溫州醫學院附屬第一醫院最早成立的臨床學科之一。著名外科學家錢禮教授是本學科創始人之一，錢教授在本學科工作期間著寫的《腹部外科學》是我國最早出版的腹部外科專著，曾影響國內一代外科醫師的成長。
經過數十年來幾代人的努力，專業隊伍不斷壯大，專業水平不斷提高。本學科專業齊全、技術力量雄厚，梯隊結構合理。下設肝膽胰外科、胃腸外科、腔鏡外科、血管外科和肛腸外科等專科。現有專科醫師45人，其中正高職稱17人，副高職稱12人，博士7人，碩士22人。病床數達150張。近年來，在本學科負責人張啟瑜教授的帶領下，學科建設取得了巨大成績。2003年，獲得浙江省衛生廳重點建設學科；2004年，獲得浙江省教育廳重點建設學科；2006年，獲得博士學位授予權。此外，技術創新、新技術推廣套用方面成績斐然：張啟瑜教授創立選擇性減斷分流術治療門脈高壓症取得良好療效，有效防治上消化道出血、緩解脾功能亢進，並改善肝功能。採用區域動脈灌注為主的早期強化復甦治療措施治療重症急性胰腺炎取得很好療效，使病死率控制在5%左右，療效達到國際先進、國內領先水平。
臨床肝移植、肝腎聯合移植和胰腎聯合移植手術等大臟器移植獲得成功，並成為常規項目，總體療效達國內先進水平。腔鏡技術得到廣泛推廣，大多數普外科醫師已熟練掌握腔鏡技術套用於腹部外科疾病的治療。肝葉切除術、胰十二指腸切除術、肝門部膽管癌切除術、膽囊癌擴大根治術等高難度手術已成為常規開展的項目。胃癌、大腸癌等胃腸道惡性腫瘤的規範化治療。腸外腸內營養在腹部外科疾病的合理套用。
本學科負責人張啟瑜教授，博士生導師，浙江省級名師。師從錢禮教授，七八十年代提出“膽腸吻合術後逆流不要緊，只要吻合口通就行”論點，八十年代創立消化道黏膜下不止血一層吻合法並推廣套用，92年在省內率先開展腹腔鏡手術，九十年代創新性地開展區域動脈灌注治療重症胰腺炎基礎與臨床研究，美國匹茲堡大學進修回國後成功開展臨床肝移植，近年來創立選擇性減斷分流術治療門脈高壓症。2006年，主編《錢禮腹部外科學》（人民衛生出版社）出版。現任國際肝膽胰協會中國分會委員，全國胰腺癌專業委員會委員，中華醫學會浙江省分會外科學會副主任委員、中華醫學會溫州外科學會主任委員。目前擔任《中華肝膽外科雜誌》、《中華實驗外科雜誌》、《中國實用外科雜誌》、《肝膽胰外科雜誌》、《浙江醫學》、《溫州醫學院學報》、《浙江臨床醫學》、《浙江創傷外科》等十餘本雜誌編委、常務編委、副主編。2004年獲“溫州市突出貢獻的科技人才”、“浙江省勞動模範”。2005年獲“全國先進工作者”榮譽稱號。
