該院是全國首批“生物學學科博士學位授與權”單位；現有6個博士點學科：生態學、細胞生物學、動物學、生物化學與分子生物學、生理學；發育生物學。14個碩士點學科：植物學、動物學、生理學、微生物學、神經生物學、水生生物學、遺傳學、細胞生物學、生物化學及分子生物學、生態學、發育生物學、課程與教學論、野生動植物保護與利用以及微生物與生化製藥 （生物學）；生物學博士後流動站；1996年被評為國家理科基礎科學研究與教學與人才培養基地。生態學和細胞生物學還是我校211工程重點建設的學科。
下設有3個系： 生物科學系、生物化學與生物技術系、生態科學系；3個研究所：生態學研究所、細胞生物學研究所、生物醫學研究所；3個重點實驗室：教育部生物多樣與生態工程重點開放實驗室、教育部細胞增殖和調控生物學重點開放實驗室、北京市基因藥物與生物技術重點實驗室；2個國家重點學科：細胞生物學、生態學；該院還是全國高等學校蛋白質組研究院的主要支撐單位。2002年，該院被國家教育部和國家計畫發展委員會批准為“國家生命科學與技術人才培養基地”。
