國內大事
1999年6月16日，南京鼓樓區人武部正規化建設通過江蘇省軍區的評定。
1999年6月16日，原國家計畫發展委員會和教育部聯合發出緊急通知，決定1999年中國高等教育在年初擴招23萬人的基礎上，再擴大招生33.7萬人，這樣普通高等院校招生總人數達到153萬。1999年普通高等院校招生增幅達到42%。同一時期，全國各大新聞媒體上“今年全國高等教育招生大幅增加”的通欄標題，引起了社會各界的強烈反響，高校擴招成為1999年最受老百姓歡迎的教育政策之一。
1999年6月16日，山東省城市防汛工作現場會在濱州召開。會議傳達了全省防洪工程建設暨防汛工作會議、省防汛抗旱指揮部第一次全體會議精神，並在對前期全省城市防汛工作交流和總結、分析的基礎上，對全省城市防汛進行了再動員、再部署。會議聽取了濱州市政府、濟南市城市防汛辦公室、濰坊市建委等關於確保全全度汛的經驗介紹，現場參觀了濱州市防洪工程的建設情況。行署副專員程竹坤到會介紹了濱州地區防汛工作概況。
1999年6月16日，中共中央總書記、國家主席、中央軍委主席江澤民在國務院副總理吳邦國、中央軍委委員王瑞林上將、陝西省委書記李建國、省長程安東等的陪同下第二次到秦始皇兵馬俑博物館視察工作。
1999年6月16日，杭州市人大代表臨安小組成員視察千畝田。
1999年6月16日，建始縣電力公司成立。
1999年6月16日 中共中央總書記、國家主席、中央軍委主席江澤民，國務院副總理吳邦國視察中國標準縫紉機集團有限公司。1999年6月16日 中共中央總書記、國家主席、中央軍委主席江澤民，國務院副總理吳邦國（時任），在陝西省委書記李建國、省長程安東、蘭州軍區政委溫宗仁、西安市委書記崔林濤、市長馮煦初陪同下，冒雨視察中國標準縫紉機集團有限公司。
1999年6月16日， 中國著名策劃師鄭建平先生接受雲南日報記者採訪時說：“世博會結束後，雲南新一輪的旅遊熱點是什麼？是祿豐恐龍”。
1999年6月16日，澳大利亞政府考察團一行16人在重慶市武陵山珍經濟技術開發有限公司總店品嘗武陵山珍。
1999年6月16日，得利斯集團遼寧分公司、四川分公司成立。
1999年6月16日，湖南益陽市政協副主席趙炳坤、段新宇就如何抓好“避災農業”來我縣調研。南縣長李德芳應邀參加會議並對我縣“避災農業”發展情況和做法進行了介紹。
1999年6月16日，按照北京市統一要求，懷柔縣勞動局正式更名為懷柔縣勞動和社會保障局。
1999年6月16日至6月18日，由東北財經大學旅遊與酒店管理學院主辦的“99飯店與旅遊管理教育國際研討會”在大連香格里拉大飯店舉行。會議吸引了美國、新加坡、英國、瑞士、香港、德國等國家的旅遊與飯店教育專家和學者，也贏得了國內著名院校的專家學者的積極回響。
1999年6月16日，為紀念王懿榮發現甲骨文100周年，煙臺市區政府籌辦了大型紀念活動，紀念館被搬遷到省級重點文物保護單位“王氏莊園、大成棧故居”。館內共分6個展廳陳列：（一）光輝生平、（二）甲骨制服、（三）興辦團練、（四）身州英烈、（五）佳作傳世、（六）啟迪後人。
1999年6月16日，由中遠總體規劃設計，國家氣象中心、英國皇家海軍水道測量局等部門聯合開發具有世界先進水平的“全球航海智慧型系統”軟體正式通過驗收，獲得中國船級社辦法的《認可證書》，中遠實現從經驗航海到數字航海的跨越。
1999年6月16日，中共中央總書記、國家主席江澤民視察漢陽陵考古發掘工地，並為計畫建立的漢陽陵博物苑題詞。
1999年6月16日，中共中央總書記、國家主席、中央軍委主席江澤民，國務院副總理吳邦國視察標準公司。
1999年6月16日，獨立音樂廠牌“人山人海”在香港誕生。
國際大事
格林1999年6月16日，在葛麗泰·嘉寶於紐約孤獨逝世9年後，按照她的遺願，其葬禮在瑞典斯德哥爾摩舉行。
1999年6月16日—20日，保加利亞外長納德日達·米哈伊洛娃應邀對中國進行正式訪問。兩國外長簽署了《中保2000-2003年教育合作協定》、《中保在社會領域裡的合作協定》等。
1999年6月16日，土耳其總統第三次訪問摩爾多瓦時，雙方一致認為，兩國間不存在任何問題和分歧，具有良好的合作前景。土耳其總統指出，兩國間的經貿關係發展順利，1998年兩國貿易額為4000萬美元。土耳其支持摩爾多瓦領土完整，歡迎摩爾多瓦用自治行政單位的方式解決加告茲少數民族問題。訪問結束時，兩國領導人簽訂了土耳其向摩爾多瓦提供技術援助的程式的協定。
1999年6月16日，雅典，格林以9秒79的成績打破世界紀錄。
1999年6月16日，庫克群島舉行大選，庫克群島黨與新聯盟黨聯合執政，傑弗里·亨利連任總理。
1999年6月16日，美國總統特使、副國務卿皮克林在北京向中國政府報告了美國政府對以美國為首的北約襲擊中國駐南斯拉夫聯盟共和國大使館事件的調查結果。
