由於各方面的原因，使親緣關係接近的類群之間在自然條件下不交配，即使能交配也不能產生後代或不能產生可育性後代的隔離機制，便稱為生殖隔離。若隔離發生在受精以前，就稱為受精前的生殖隔離，其中包括地理隔離、生態隔離、季節隔離、生理隔離、形態隔離和行為隔離等；若隔離發生在受精以後，就稱為受精後的生殖隔離，其中包括雜種不活、雜種不育和雜種衰敗等。
生殖隔離
因生殖方面的原因使親緣關係相近的類群間不雜交，或雜交不育，或雜交後產生不育性後代的現象。實質是不同種群內的個體，因受不同基因型控制而有不同的生殖行為及相關生殖率，故種群間的基因流動受到限制或被阻止。根據影響基因流動的障礙不同分為：①外在生殖隔離。基因流動的障礙是個體受精前外在的影響，包括機械隔離、行為隔離、季節隔離和配子隔離。如菊科萵苣屬（Latuca）的L. canadensis和L. gra- minifolia，分布於美國東南部，人工雜交可育，但在自然界中，前者夏季開花而後者春季開花，得以保持兩個個別的形態各異的生殖隔離種；②內在生殖隔離。基因流動受到個體內部的影響。由不同群體的配子體、配子、染色體或基因間不能相互作用所致，包括不親和性、雜種不存活、雜種不孕、雜種破落等4種隔離。如馬（Equus caballus）和驢（E. asinus）雜交，不能產可育的雜種後代。地理隔離和生態隔離都含有生殖隔離的意義。生殖隔離是隔離的重要內容，是物種演化的一個因素和物種形成的必要條件。在成種過程中，一般先有地理隔離，後有生殖隔離。
例子：驢和馬生出了不能生育的騾子。
