發展說明
1952年在全國高校院系調整中，北京大學醫學院脫離北京大學，獨立為北京醫學院。1985年更名為北京醫科大學。2000年與北京大學合併，組建了新的北京大學，北京醫科大學成為北京大學醫學部。
北京大學醫學部北醫前身是國立北京醫學專門學校，創建於1912年10月26日，是中國政府開辦的第一所國立醫學院校。是民國早期九所著名“國立”高校之一。其歷史淵源可以上溯到1903年－1907年之間曾經存在過的京師大學堂醫學實業館。1913年國立北京醫學專門學校首批學生72人，到1917年首批畢業學生共22人。
1923年北京醫學專門學校更名為北京醫科大學，1927年奉系軍閥張作霖率安國軍進入北平，進京後的張作霖改組高等教育，把當時北平“國立”九校合併為“京師大學校”，北醫更名為京師大學校醫科；1928年國民黨的北伐大軍兵臨城下，張作霖離開北京，之後一些高校復校，包括北醫在內未復校的高校成為北平大學的一部分，北醫成為北平大學醫學院。
1937年盧溝橋事變爆發後，北平各高校紛紛西遷南遷，北平大學大部撤離到了古都西安並在那裡和北洋大學等華北名校一起組成了西北聯合大學。與此同時，部分未撤離北平的醫學院教師在日占區繼續行醫、教學，並組建了北京大學醫學院，院長為鮑鑒清。太平洋戰爭後北京大學醫學院吸收了美屬北平協和醫學院的部分師資。如林巧稚，諸福堂等均曾在這任過職。有人也把1937-1945年這段時期稱為“偽北京大學”醫學院。
1945年，國民政府教育部決定在國立北京大學、國立浙江大學、國立山東大學和國立武漢大學四所高校設立醫學院。原北京大學醫學院改組為北平臨時大學補習班第六分班，該班連同附屬醫院(北大醫院)再次組成北京大學醫學院。院長為馬文昭。部份原醫學院教授遭解職。而新聘師資中雲集了一大批歐美留學博士。這些人代表當時學界最高水平，後來均成為學界泰斗。如
基礎學科有：組織馬文昭,神經解剖臧玉洤，解剖劉其端，免疫陶善敏、顏春輝，細菌學謝少文、方亮，生化劉思職、張昌穎，醫史李濤，寄生蟲馮蘭洲，病理林振剛，秦光煜；藥理李鉅，生理沈寯淇，公衛林宗揚、嚴鏡清, 藥學薛愚，王序等。
臨床學科有：傳染病吳朝仁，熱帶病鍾惠瀾，腎臟病王叔鹹，胃腸陳國楨，心臟病馬萬森，腦外科關頌韜，泌尿外科謝元甫，骨科孟繼懋、陳景雲，胸外王大同，腫瘤外科司徒展，兒科諸福棠，皮膚花柳病胡傳揆，神經精神病許英魁，眼科畢華德、劉家琦，耳鼻喉科劉瑞華、張慶松、徐蔭祥，放射汪紹訓，謝志光，口腔毛燮均、鍾之奇、胡郁斌教授等。
原北平大學醫學院的師生未回北平，而是留在西安建立了西安醫科大學（現為西安交通大學醫學院）。
1954年，北京醫學院成為全國六所重點院校之一。
1958年，原中央醫院併入北醫，成為第二附屬醫院(現北京大學人民醫院)。從北大醫院，建工醫院和平安醫院新組建了北醫三院。
1959年，北京醫學院成為全國十六所重點院校之一
1960年，北京醫學院組建北京第二醫學院(現首都醫科大學)。同時大批骨幹師資西行洛陽，蘭州，內蒙，酒泉等地支援地方建設。
1985年，更名為北京醫科大學。並成為全國10所重點建設院校之一。
1996年，成為國家首批“211工程”重點支持的醫科大學。
2000年4月3日，與北京大學合併，組建了新的北京大學，北京醫科大學成為北京大學醫學部。
北京大學醫學部地處北京市海淀區中關村科技園區，集教學、科研、醫療為一體，以本科教育、研究生教育為主，學科復蓋基礎醫學、臨床醫學、口腔醫學、藥學、預防醫學、護理學等六大門類、專業齊全，臨床醫學和口腔醫學實行八年制。現有9個本科專業：基礎醫學、臨床醫學、口腔醫學、藥學、套用藥學、預防醫學、護理學、英語（生物醫學英語方向）、醫學實驗學，1個專科專業：護理學 。成人高等醫學教育本專科專業9個。現有12個一級學科博士、碩士授權點，47個二級博士學位授權點和59個二級學科碩士學位授權點，6個博士後流動站。北醫是國家“211工程”和“985工程”首批建設的高等學校之一。
北醫設有6個學院：基礎醫學院、藥學院、公共衛生學院、護理學院、公共教學部、醫學網路教育學院，8家附屬醫院和13家教學醫院，承擔臨床醫學的教學、實習任務和向社會提供醫療保健服務。
北醫擁有大批國際、國內知名的醫學教育、研究、臨床方面的專家，其中具有高級職稱1866人，11位兩院（中國科學院、中國工程院）院士，國務院學位委員會學科評議組成員9人， 17位長江學者，博士生導師276人，國家有突出貢獻專家16人，入選人事部“新世紀百千萬人才工程”國家級人選2人，入選教育部“新世紀人才支持計畫”19人。
學校擁有24個國家級重點學科，1個國家重點實驗室，9個部級重點實驗室。1981-2006年的25年間，承擔了國家“六五”、“七五”、“八五”、“九五”、“十五”、“十一五”國家科技攻關的重點項目、國家自然科學基金研項目及“863”、“973”等相關重點項目，獲得多項國家級和省、部級科研成果，“十五”期間，醫學部承擔國家和省部級科研項目1099項，總經費達3.827億元人民幣；發表的SCI收錄論文1347篇，連續數年在全國醫學學科領域排名第一。在國際頂尖級雜誌如《Nature》《Science》及其系列雜誌、國際著名醫學期刊（New Engl. J.Med 、Lancet、British Medical Journal）發表了一批高水平論文或綜述，在基礎醫學、臨床醫學、公共衛生和預防醫學及藥學等學科領域取得了多項標誌性成果。多門課程被評為國家級和北京市級精品課程。
北醫與國際上著名的大學和科研機構在人才培養、科學研究、學術研討等方面開展了廣泛的交流與合作。如互派人才進修與交流、舉辦大型國際學術會議、邀請國外、境外知名學者作各類學術報告、與國外著名大學和科研機構搭建高水平的學術交流平台。已與海外75所學校簽訂了合作協定，如Duke University（杜克大學）、Yale University（耶魯大學） John Hopkins University（約翰霍普金斯大學） Columbia University（哥倫比亞大學大學）、Emory University (愛默里大學)、世界衛生組織 (WHO)、美國國家衛生研究院（NIH）、美國疾病預防控制中心（CDC）等。建立了5箇中外合作中心和58個學生交流活動項目，設立了22項國際學生交流獎學金項目，搭建起國際醫學教育資源共享的平台。通過與中華醫學基金會、WHO、NIH、CDC、世界銀行、霍普金斯基金會等國際機構保持的良好工作關係，獲得科研與人才培訓基金。廣泛的國際交流與合作，促進了北醫的人才培養與醫學科學研究的進展。
2000年與北京大學合校後，北京大學醫學部本著“實事求是”與“發展是硬道理”的原則，採取以條塊結合，逐步融合為方針的管理體制，利用合校後的學科綜合優勢，不斷發展學科建設，推動醫學教育改革與科學研究，努力改善基礎設施條件。啟動並不斷探索醫學、藥學與預防醫學學生長學制的培養模式，大力推進醫學學科與理科、人文社會學科的交叉，學科建設更是得到有力加強，學科布局進一步最佳化，促進了基礎醫學與臨床醫學、醫學和藥學、預防和治療的結合，促進了生物醫學與數學、物理、化學、力學、電子學等多學科的交叉，形成了人體幹細胞工程研究與套用、人類功能基因和疾病基因研究和循證醫學等若干個新興的交叉學科群。在此基礎上，醫學部完善和建立了一批科研和技術平台，同時根據學科發展和重大疾病防治研究的需要，利用北京大學學科齊全的綜合優勢，成立了糖尿病研究中心、醫學遺傳學中心、衰老研究中心、感染病研究中心等研究機構。北京大學生物醫學跨學科研究中心也得到了發展，為開展多學科或跨學科合作研究、面向國家重大需求與承擔國家重大任務創造了更加有利的條件。
今天的北京大學醫學部正在飛速發展，這所由中國政府創立的第一所醫學院校，在國家的大力支持下，秉承“勤奮，嚴謹，求實，創新”的學風和“堅定正確的政治方向，嚴謹求實的治學態度，熱忱服務的獻身精神”的校風，以更堅實有力的步伐，在創建世界一流大學的進程中再創輝煌，實現她自己的最高目標：盡其所能，為了人類健康事業的發展，創造世界一流的醫學教育事業。
（上述文字中的數字統計截止到2007年7月）
藥學系歷史
北京大學醫學院藥學系前身為北京大學藥學院，始建於1941年，原名為北京大學中藥研究所，1943年以此為基礎建立了北京大學醫學院藥學系，設本草專業和製藥專業；1952年醫學院獨立建院，隨之改名為北京醫學院藥學系，設藥學、藥物化學、套用化學（醫藥）三個專業；1985年隨學校更名為北京醫科大學藥學院，設藥學、藥物化學、藥理學三個專業。2000年4月原北京醫科大學和北京大學合併組建新的北京大學，隨之更名為北京大學藥學院。
1945年劉思職教授任系主任，1946年薛愚教授任系主任，1958年王序教授任系主任，1983年王夔教授任系主任，1985年學校更名後王夔教授任院長；1988年張禮和教授任院長。1999年彭師奇教授任院長；2004年劉俊義教授任常務副院長；2005年劉俊義教授任院長。
至今藥學院已有四名教授遴選院士，其中王序教授、王夔教授、張禮和教授為中國科學院院士，樓之岑教授為中國工程院院士。
藥學院現有在職職工194名，其中教授35名、副教授39名，中國科學院院士2名，“長江學者獎勵計畫”特聘教授1名，傑出青年基金獲得者5名，教育部跨世紀（新世紀）人才3名，教育部創新團隊1 個；全國優秀教師1名，北京市教學名師1名，北京市優秀教師8名，博士生導師27名、碩士生導師41名，具有博士學位的教師61名，占專任教師總數的50.4%，具有碩士學位的教師42名，占專任教師總數的34.7%。
藥學院現設有化學生物學系、藥物化學系、天然藥物學系、藥劑學系、分子與細胞藥理學系、藥事管理與臨床藥學系、實驗教學中心、套用藥物研究所，一個首批建立的國家重點實驗室——天然藥物及仿生藥物國家重點實驗室，三個國家重點學科即生藥學、藥物化學和藥理學。
有藥物化學、生藥學、藥劑學、化學生物學和臨床藥學5個博士點和藥物化學、生藥學、藥劑學、藥物分析學、無機化學、臨床藥學6個碩士點；藥學作為一級學科為藥學博士後流動站和“大藥學”博士點，標誌著藥學院各學科均可招收博士生。學院現有各類學生2217人，其中博士生、統招研究生、研究生班學生297人，六年制本碩連讀學生570人，四年制本科學生153人，承認教育專升本、專科學生1197人。
2001年經教育部批准開始招收6年制本碩連讀的長學制學生。在實施長學制招生計畫和六年一貫、本碩融通的培養模式後，學院注意轉變教學思想，更新“教與學” 的觀念。以不斷提高人才培養質量為目標，在教學體系、教材建設、課程設定、師資培養、素質教育等方面做出了較大的調整與改革。在“加強基礎、注重素質、因材施教、強調創新、面向未來”的培養方針下，突出了學生能力和學習主動性的培養，逐步建立以學生為主體的個性化教育模式，大力提倡教授講授基礎課，加大推進本科生早期進入實驗室的力度，適當減少了課堂授課時間。制訂了長學制分流條件及二級學科培養細則，培養方案不斷完善，成效顯著。
為適應不同層次人才的需要，編寫了多種高水平教材，其中為六年制本碩連讀編寫的特色教材17部已正式出版9部；主編全國規劃教材8本，參編10本。有12本教材獲“十一五”規劃教材立項，2本教材被評為北京市高等教育精品教材，3本教材獲北京市高等教育精品教材立項。《有機化學》、《物理化學》分別獲2006年全國高等學校醫藥優秀教材二、三等獎。《無機化學》、《藥用植物學》被評為北京大學、北京大學醫學部優秀教材。《藥物化學》獲得2006年國家精品課程。
教育改革研究《大藥學教學改革與實踐》獲2001年北京市教學成果一等獎、國家級教學成果二等獎，《21世紀初藥學研究型人才培養模式研究與實踐》獲2004年北京市教學成果一等獎，《全面改革醫藥專業化學實驗教學模式、課程體系和內容，培養高素質創新人才》獲2004年北京大學教學成果一等獎，《藥學院新生導師制的創建與發展》獲2004年北京大學教學成果二等獎。承擔著十幾項教育教學立項課題研究，其中包括“十一五”高等教育教學改革課題立項5個。
學院的科學研究主要集中在“三大疾病”即心腦血管疾病、腫瘤、老年性疾病；以及在核酸、寡糖、多肽和微量元素 “四大內源性物質”和天然藥物等領域的基礎研究。以國家重點實驗室（天然藥物與仿生藥物國家重點實驗室）為核心，重點學科（藥物化學、生藥學、藥理學）為依託，在核酸化學、多肽化學、糖化學、生物無機化學等方面積累了較雄厚的基礎，取得了國內領先、國際上有影響的成績，有些研究已處於國際前沿水平。在分子藥理、細胞化學、藥物設計、篩選等基礎研究和套用基礎研究也達到與國際同步水平。承擔著多項國家自然科學基金重點項目、國家“863”項目、“973”項目、國家科技攻關項目以及省部級科研項目，參與了“九五”211工程和“十五”“211”工程項目的建設。
近五年發表論文965篇，其中被SCI收錄的416篇；獲各級各類科研成果獎30項，其中國家級4項，部、委、局、北京市級26項；獲國家各級名類科研經費（“縱向”）4500萬元。
藥學院與國際國內科研院所、製藥企業有著廣泛的合作與交流。與美國 、英國、法國、德國、日本、荷蘭等國家及港、澳、台地區等十幾所大學或公司建立了友好合作關係，聘請外籍名譽教授4名、客座教授11名，對內、對外交流的擴大和加深促進了藥學院整體地位與水平的穩步提高。
北京大學藥學院今後幾年的奮鬥目標是：逐步發展為一所學科齊全、具有國際一流水平的藥學院。
歷任領導
北京醫科大學歷任校(院)長、主任 (1912―2000年)
姓 名 名 稱 職 務 任職時間 備註
湯爾和國立北京醫學專門學校 校長 1912.10--1915.12
葛成勛 國立北京醫學專門學校 校長 1915.12--1916.08
湯爾和 國立北京醫學專門學校 校長 1916.08--1922.04
周頌聲 國立北京醫學專門學校 校長 1922.04--1923.12
洪式閭 國立北京醫科大學校 校長 1924.01--1925.08
張黼卿 國立北京醫科大學校 校長 1925.08--1926.01
孫柳溪 國立北京醫科大學校 校長 1926.01--1927.08
孫柳溪 國立京師大學校醫科 學長 1927.08--1928.11
徐誦明 國立北平大學醫學院 院長 1928.11--1932.08
吳祥風 國立北平大學醫學院 院長 1932.08--1937.09
鮑鑒清 國立北京大學醫學院 院長 1938.03--1945.08
馬文昭 北平臨時大學第六分班 班主任 1945.09--1946.09
馬文昭 國立北京大學醫學院 院長 1946.09--1947.08
沈寯琪 國立北京大學醫學院 院長 1947.08--1948.08
胡傳揆 國立北京大學醫學院 院長 1948.08--1952.12
胡傳揆 北京醫學院 院長 1952.12--1968.08
閻登山 北京醫學院革命委員會 主任 1968.09--1973.12 軍宣隊
薛偉民 北京醫學院革命委員會 主任 1975.06--1977.09
胡傳揆 北京醫學院 名譽院長 1979.11--1986.03
馬 旭 北京醫學院 院長 1979.11--1983.01
曲綿域 北京醫學院 院長 1983.01--1985.05
曲綿域 北京醫科大學 校長 1985.05--1991.06
王德炳 北京醫科大學 校長 1991.06--2000.03
韓啟德 北京大學醫學部 主任 2000.04--
北京醫科大學黨組織負責人(1952－2000年)
姓 名 名 稱 職 務 任職時間 備註
王 琦 國立北京大學醫學院 總支書記 1950.03--1950.09
彭瑞驄 國立北京大學醫學院 總支書記 1950.09--1954.04
秦德遠 北京醫學院 總支書記 1954.04--1955.04
閻 毅 北京醫學院 黨委書記 1955.04--1956.07
曲 正 北京醫學院 黨委書記 1956.07--1959.03
曲 正 北京醫學院 黨委第一書記 1959.03--1959.12
楊 純 北京醫學院 黨委書記 1960.01--1962.06
楊 純 北京醫學院 黨委書記 1962.06--1966.02
馬 旭 北京醫學院 代理書記 1964.11--1966.06
閻登山 北京醫學院 黨委書記 1971.06--1973.12 軍宣隊
薛偉民 北京醫學院 黨委書記 1975.06--1976.10
薛偉民 北京醫學院 黨委書記 1976.10--1977.09
李資平 北京醫學院 黨委書記 1977.11--1980.11
彭瑞驄 北京醫學院 黨委書記 1980.11--1985.05
彭瑞驄 北京醫科大學 黨委書記 1985.05-1987.02
彭瑞驄 北京醫科大學 黨委書記 1987.02--1993.07
王德炳 北京醫科大學 黨委書記 1993.09--1997.12
王德炳 北京醫科大學 黨委書記 1997.12--2000.04
林久祥 北京大學醫學部 黨委書記(兼) 2000.04--2001.12
郭 岩 北京大學醫學部 黨委書記 2002.01--2005.04
敖英芳 北京大學醫學部 黨委書記 2005.06--
