1.染色體性別
在染色體層面上，人類具有23對46條染色體，其中22對44條染色體被稱為常染色體，主要調控身體的發育，而與性別發育相關的被稱為性染色體，通常用“X”和“Y”來表達。1959年，學者發現人的性別是由Y染色體決定的，一個個體無所謂有多少條X染色體，只要沒有Y染色體就是女性；只要有一條Y染色體，那么就是男性。比如先天性睪丸發育不全綜合徵，也就是克氏綜合徵，染色體核型是47，XXY，就是男性；超雄綜合徵，染色體核型是47，XYY，即很陽剛的染色體病患者，也是男性。在世界上，必須要明確性別的，在體育賽事中比較多見，國際奧林匹克委員從1968年的第19屆現代奧運會上，第一次對女性運動員做了性別檢查。由於競技運動尤其是體能類運動項目，男性占有明顯優勢，因此，檢查的目的是為了消除競賽中的欺騙行為，維護奧運會女子比賽的公平性。這個檢測不是婦科檢查，而是染色體檢查。曾經，波蘭著名的短跑選手，克洛布科斯卡，被發現具有罕見的XXY染色體病，因此被禁止參加女子比賽。據統計，奧運會項目中，每400名女運動員中就有1人含有Y染色體。攜帶有Y染色體，就是男性。這在國際上是統一的。
這是染色體性別。
2.基因性別
1990年，學者們在Y染色體上找到了睪丸決定基因，也就是著名的SRY基因，這個基因具有重要的性別導向作用。胚胎學的研究證明：原始性腺是沒有性別差異的，它既可以向男性生殖發育，也可以向女性生殖發育。如果受精卵中有Y染色體時，染色體上SRY基因發揮正常作用的，原始性腺在胚胎髮育到第7周的時候，就會向睪丸方向發展，睪丸再分泌睪酮，就決定這個胎兒的表型也就是第一性徵向男性發育，出生後為男嬰。如果受精卵中沒有Y染色體或是有Y染色體而缺乏SRY基因，或SRY基因失活，在胚胎第8周的時候，原始性腺就向卵巢方向發展，卵巢分泌的女性激素，促使胚胎內外生殖器向女性方向發展。
臨床上有一種發病率很低，約1/10萬的性逆轉綜合徵，染色體核型是46，XY，通過染色體判斷其是男性，但其臨床表型是女性，內外生殖器表現的完全是女性，性徵與核型不一致，問題就出在睪丸決定基因上。睪丸決定基因在孕早期沒有發揮作用。
3.性腺性別
如果有SRY基因，原始性腺在胚胎第7周的時候，就會向睪丸方向發展，睪丸分泌睪酮，這個胎兒就向男性發育。如果受精卵中沒有Y染色體或是有Y染色體而缺乏SRY基因，或SRY基因失活，在胚胎第8周的時候，原始性腺就發展為卵巢，出生後看起來就是女性。性腺是睪丸的時候，不論外陰是男孩還是女孩，都稱為男性假兩性畸形；性腺為卵巢時，即使外陰像男孩，也稱為女性假兩性畸形，性腺很關鍵。
4.生殖器性別
外生殖器男孩為陰莖、陰囊和睪丸，女孩為陰蒂、陰唇和陰道；內生殖器性別一般需要通過專業檢查而確定，男孩為精索、精囊和前列腺等，女孩為子宮、輸卵管和卵巢等。5.心理性別
心理性別是一個人的心理對自己性別的認同，這一方面與基因調控相關，也與親職教育和角色認定有關。一般認為，性別認定從1～2歲開始形成，3～5歲的幼兒時基本完成。因此，孩子存在性徵模糊時，父母一定要及早帶去檢查和治療，以免在性別認定上形成“倒錯”，造成心理和人格的扭曲。另外，父母要重視在孕育過程中的飲食和用藥，以及養育過程中的性別認同教育。6.社會性別
社會性別也就是社會上，熟悉的人包括家人、朋友、周圍人群、社會機構等對一個人性別的認同，比如祝英台和花木蘭，本來是女性，可是，她們的社會性別一度是男性。總之，這六種性別，如果高度統一，就不存在性別模糊，如果不是很統一，就說明存在問題。
