主要職責
（二）負責動物疫病防治工作。擬訂重大動物疫病防治政策和國家控制撲滅計畫，並組織實施；組織外來動物疫病及新發動物疫病防治工作；負責動物疫病區域化管理工作；負責動物防疫應急管理。
（三）負責動物疫情管理工作，組織動物疫病監測和風險評估，發布預警信息和疫情信息。
（四）負責動物衛生監督管理，組織動物及動物產品檢驗檢疫、動物防疫條件審核、動物標識及動物產品可追溯管理；負責動物衛生監督執法工作。
（五）負責獸醫醫政和獸藥藥政藥檢工作。負責官方獸醫、執業獸醫及其他獸醫從業人員管理；負責動物診療機構管理。
（六）負責獸醫及獸藥相關實驗室、檢驗機構管理；負責國家獸醫參考實驗室、獸藥檢驗和安全性評價機構資格認定；負責動物病原微生物和實驗室生物安全管理。
（七）負責獸藥、獸醫器械研製、生產、經營、使用及進出口監督管理；負責藥物飼料添加劑、禁止使用的藥品及其他化合物的監督管理，提出國家獸藥殘留監控計畫並組織實施。
（八）提出獸醫科研、技術推廣項目建議，承擔重大科研、推廣項目的遴選及組織實施工作；組織擬訂動物衛生、獸醫器械相關標準和技術規範，擬訂並實施獸藥、獸藥殘留限量和殘留檢測方法國家標準；組織實施獸醫標準化工作。
（九）承辦政府間獸醫雙邊、多邊協定、協定的談判和簽署工作；承辦與世界動物衛生組織等國際組織獸醫交流與合作，提出動物衛生技術性措施建議；承擔世界動物衛生組織涉及動物福利的相關工作；承辦《禁止生物武器公約》等履約的相關工作。
（十）分析評估國（境）外有關動物衛生信息；承辦確定和調整禁止入境的動物及動物產品名錄；承辦制定並發布動物及動物產品出入境禁令、解禁令等相關工作。
（十一）編制獸醫領域基本建設規劃，提出項目安排建議並組織實施；編制本領域財政專項規劃，提出部門預算和專項轉移支付安排建議並組織或指導實施。
（十二）負責中獸醫管理工作。
（十三）指導歸口管理的事業單位和社團組織的業務工作。
（十四）承辦部領導交辦的其他工作。
機構設定
（一）綜合處
（二）醫政處（農業部執業獸醫管理辦公室）
（三）科技與國際合作處
（四）防疫處
（五）檢疫監督處
（六）藥政藥械處
