選秀規則
2006年選秀合影選秀大會透過美國ESPN電視台向全世界202個國家和地區進行直播。
選秀的主要前奏，2006年NBA選秀樂透，2006年5月23日在新澤西州的希咯甚市（Secaucus）舉行。樂透抽籤首先先召集未能進入NBA季後賽的14支球隊舉行抽籤儀式，來決定未來頭三號新秀權的歸屬。抽籤儀式中，主持人會拿出編號為1-14號的14個桌球放在一個容器中，從14個球中隨意抽出4個球，不計數字的先後順序，一共可以產生1001種可能的組合，而去掉這個11-12-13-14組合，正好還剩下1000種。
抽籤前，沒有獲得季後賽資格的各隊已經依照常規賽戰績倒序排名，得到與之相應的贏取狀元簽的組合數（機率）。比如有14支球隊沒有進入季後賽，這14支球隊中戰績最差的波特蘭開拓者就得到250種組合，即有25%的機會贏得狀元簽，戰績第二差的尼克斯隊）得到199種，即19.9%的幾率，依此類推。（例如：休斯敦火箭戰績第八差，所以只能得到23種，即2.3%的機會贏得狀元簽。）
在“狀元簽”抽出之後，四個桌球將被放回容器中，重新去決定二號和三號選秀權的歸屬，此後首輪剩餘的4-30號選秀簽位和第二輪（31－60）的選秀簽位，則按照常規賽的成績倒序決定。
第一輪
| 順位 | 球員 | 位置 | 所屬球隊 |
| 1 | 安德里亞·巴格納尼 | PF | 多倫多猛龍隊 （現效力於 布魯克林 籃網隊） |
| 2 | 拉馬庫斯·阿爾德里奇 | PF | 芝加哥公牛隊 （現效力於聖安東尼奧馬刺隊） |
| 3 | 亞當·莫里森 | SF | 夏洛特山貓隊 （現已退役） |
| 4 | 泰魯斯·托馬斯 | PF | 波特蘭開拓者隊 （自由球員） |
| 5 | 謝爾頓·威廉士 | PF | 亞特蘭大老鷹隊 （現效力於CBA天津融寶支付） |
| 6 | 布蘭頓·羅伊 | SG | 明尼蘇達森林狼隊 （現已退役） |
| 7 | 蘭迪·弗耶 | SG | 波士頓凱爾特人隊 （現效力於 丹佛掘金隊 ） |
| 8 | 魯迪·蓋伊 | SF | 休斯敦火箭隊 （現效力於 薩克拉門托國王隊 ） |
| 9 | 派屈克·奧布萊恩特 | C | 金州勇士隊 （現為自由球員） |
| 10 | 賽爾·希尼 | C | 西雅圖超音速隊 （現為自由球員） |
| 11 | J.J.雷迪克 | SG | 奧蘭多魔術隊 （現效力於 洛杉磯快船隊 ） |
| 12 | 希爾頓·阿姆斯特朗 | C | 紐奧良黃蜂隊 （現效力於土耳其貝西克塔斯隊） |
| 13 | 薩博·塞弗羅薩 | SF | 費城76人隊 （現效力於 亞特蘭大老鷹隊 ） |
| 14 | 羅尼·布魯爾 | SG | 猶他爵士隊 （現為自由球員） |
| 15 | 塞德里克·西蒙斯 | PF | 紐奧良黃蜂隊 （現為自由球員） |
| 16 | 羅德尼·卡尼 | SF | 芝加哥公牛隊 （現效力於委內瑞拉加拉加斯鱷魚） |
| 17 | 肖恩·威廉士 | SF | 印第安納步行者隊 （現為自由球員） |
| 18 | 奧萊克西·佩切洛夫 | PF | 華盛頓奇才隊 （現為自由球員） |
| 19 | 昆西·杜比 | SG | 薩克拉門托國王隊 （現為自由球員） |
| 20 | 雷納多·巴爾克曼 | SF | 紐約尼克斯隊 （現效力於NBDL德克薩斯傳奇） |
| 21 | 拉簡·朗多 | PG | 菲尼克斯太陽隊 （現效力於薩克拉門托國王隊） |
| 22 | 馬庫斯·威廉士 | PG | 新澤西籃網隊 （現效力於塞爾維亞貝爾格勒紅星） |
| 23 | 約什·布恩 | C | 新澤西籃網隊 （現效力於巴林麥納麥） |
| 24 | 凱爾·洛瑞 | PG | 孟菲斯灰熊隊 （現效力於多倫多猛龍） |
| 25 | 香農·布朗 | SG | 克里夫蘭騎士隊 （現為自由球員） |
| 26 | 喬丹·法瑪爾 | PG | 洛杉磯湖人隊 （現為自由球員） |
| 27 | 塞爾吉奧·羅德里格斯 | PG | 菲尼克斯太陽隊 （現效力於紐約尼克斯） |
| 28 | 莫里斯·艾格 | SG | 達拉斯小牛隊 （現為自由球員） |
| 29 | 馬蒂·科林斯 | PG | 紐約尼克斯（現效力于波蘭綠山城） |
| 30 | 喬爾·福里蘭德 | PF | 波特蘭開拓者 |
第二輪
| 順位 | 球員 | 位置 | 所屬球隊 |
| 31 | 詹姆斯·懷特 | SG | 波特蘭開拓者（現效力於俄羅斯喀山尤尼克斯） |
| 32 | 史蒂夫·諾瓦克 | SF | 休斯敦火箭（現效力於俄克拉荷馬雷霆） |
| 33 | 所羅門·瓊斯 | C | 亞特蘭大鷹隊（現為自由球員） |
| 34 | 保羅·戴維斯 | C | 洛杉磯快船（現效力於俄羅斯希姆基） |
| 35 | P.J.塔克 | SF | 多倫多猛龍（現效力於菲尼克斯太陽） |
| 36 | 克雷格·史密斯 | PF | 明尼蘇達森林狼（現效力於以色列內斯齊奧納） |
| 37 | 鮑比·瓊斯 | SF | 明尼蘇達森林狼（現效力於義大利羅馬） |
| 38 | 科斯塔·佩羅維奇 | C | 金州勇士（現效力於俄羅斯葉尼塞） |
| 39 | 大衛·諾爾 | SF | 密爾沃基雄鹿 （現效力於法國奧爾良） |
| 40 | 德漢·布朗 | SG | 西雅圖超音速（現效力於羅馬尼亞特爾古穆列什） |
| 41 | 詹姆斯·奧古斯丁 | PF | 奧蘭多魔術（現效力於俄羅斯希姆基） |
| 42 | 丹尼爾·吉布森 | PG | 克里夫蘭騎士（現已退役） |
| 43 | 馬庫斯·文尼西斯 | SF | 紐奧良黃蜂（現效力於巴西弗拉門戈） |
| 44 | 里奧·埃利亞胡 | SF | 奧蘭多魔術 （現效力於以色列耶路撒冷工人） |
| 45 | 亞歷山大·詹森 | PF | 印第安那步行者（現為自由球員） |
| 46 | 迪·布朗 | PG | 猶他爵士 （現效力於羅馬尼亞普洛耶什蒂） |
| 47 | 保羅·米爾薩普 | PF | 猶他爵士（現效力於亞特蘭大老鷹） |
| 48 | 維拉德瑪·威勒明科 | PF | 華盛頓奇才（現效力於土耳其班維特） |
| 49 | 里昂·鮑威 | PF | 丹佛掘金（現已退役） |
| 50 | 萊恩·霍林斯 | C | 夏洛特山貓（現效力於薩克拉門托國王） |
| 51 | 切克·薩姆布 | C | 洛杉磯湖人（現效力於阿聯阿赫利） |
| 52 | 吉勒莫-迪亞茲 | SG | 洛杉磯快船（現效力于波多黎各阿雷西博領袖） |
| 53 | 尤塔姆·哈爾佩林 | PG | 西雅圖超音速（現效力於以色列耶路撒冷工人） |
| 54 | 哈桑·亞當斯 | SG | 新澤西網隊（現效力於新加坡司令） |
| 55 | 艾克·尤波亞 | PF | 克里夫蘭騎士（現效力於土耳其伊斯坦堡技術學院） |
| 56 | 埃丁·巴夫切齊 | C | 多倫多猛龍 （現效力於科索沃普里什蒂納） |
| 57 | 魯卡斯·馬弗洛克法里蒂斯 | C | 明尼蘇達森林狼（現效力於希臘帕納辛奈科斯） |
| 58 | 達尼洛·平洛克 | SG | 達拉斯小牛（現為自由球員） |
| 59 | 達米爾-馬爾科塔 | SF | 聖安東尼奧馬刺（現效力於克羅埃西亞薩格勒布希伯納） |
| 60 | 維爾·布拉洛克 | PG | 底特律活塞（現為自由球員） |
選秀名單
第一輪
| 順位 | 球員 | 國籍 | 所屬球隊 | 學校/前屬俱樂部 |
| 1 | 安德里亞·巴格納尼(PF) | 義大利 | 多倫多猛龍（現效力於紐約尼克斯） | 貝納通特維索（義大利聯賽） |
| 2 | 拉馬庫斯·阿爾德里奇(PF) | 美國 | 芝加哥公牛（換去波特蘭開拓者選秀權 轉手過紐約尼克斯） | 德州州立大學奧斯汀分校 |
| 3 | 亞當·莫里森(SF) | 美國 | 夏洛特山貓 | 岡再伽大學 |
| 4 | 泰魯斯·托馬斯(PF) | 美國 | 波特蘭開拓者（換去芝加哥公牛） | 路易斯安那州立大學 |
| 5 | 謝爾頓·威廉士(PF) | 美國 | 亞特蘭大鷹隊 | 杜克大學 |
| 6 | 布蘭頓·羅伊(SG) | 美國 | 明尼蘇達森林狼（換去波特蘭開拓者） | 華盛頓大學 |
| 7 | 蘭迪·弗耶(SG) | 美國 | 波士頓凱爾特人（現效力于丹佛掘金） | 維拉諾瓦大學 |
| 8 | 魯迪·蓋伊(SF) | 美國 | 休斯敦火箭 （換去孟菲斯灰熊， | 康乃狄克大學 |
| 9 | 派屈克·奧布萊恩特(C) | 美國 | 金州勇士 | 布萊德利大學 |
| 10 | 賽爾·希尼(C) | 塞內加爾 | 西雅圖超音速 | RBC Verviers-Pepinster（比利時） |
| 11 | J.J.雷迪克(SG) | 美國 | 奧蘭多魔術（現效力於洛杉磯快船） | 杜克大學 |
| 12 | 希爾頓·阿姆斯特朗(C) | 美國 | 紐奧良黃蜂 | 康乃狄克大學 |
| 13 | 薩博·塞弗羅薩(SF) | 瑞士 | 費城76人（換去芝加哥公牛， | Angelico Biella（義大利） |
| 14 | 羅尼·布魯爾(SG) | 美國 | 猶他爵士 | 阿肯色大學 |
| 15 | 塞德里克·西蒙斯(PF) | 美國 | 紐奧良黃蜂 （來自密爾沃基雄鹿） | 北卡羅萊納州立大學 |
| 16 | 羅德尼·卡尼(SF) | 美國 | 芝加哥公牛（換去費城76人） | 孟菲斯大學 |
| 17 | 肖恩·威廉士(SF) | 美國 | 印第安那步行者 | 孟菲斯大學 |
| 18 | 奧萊克西·佩切洛夫(PF) | 烏克蘭 | 華盛頓奇才 | Paris Basket Racing（法國） |
| 19 | 昆西·杜比(SG) | 美國 | 薩克拉門托國王（現效力於浙江潮州銀行俱樂部） | 羅格斯大學 |
| 20 | 雷納多·巴爾克曼(SF) | 美國 | 紐約尼克斯（來自丹佛掘金） | 南卡羅萊納大學 |
| 21 | 拉簡·朗多(PG) | 美國 | 菲尼克斯太陽（換去波士頓凱爾特人選秀權，轉手過洛杉磯湖人） | 肯塔基大學 |
| 22 | 馬庫斯·威廉士(PG) | 美國 | 新澤西網隊（來自洛杉磯快船） | 康乃狄克大學 |
| 23 | 約什·布恩(C) | 美國 | 新澤西網隊 | 康乃狄克大學 |
| 24 | 凱爾·洛瑞(PG) | 美國 | 孟菲斯灰熊（現效力於多倫多猛龍） | 維拉諾瓦大學 |
| 25 | 香農·布朗(SG) | 美國 | 克里夫蘭騎士 | 密西根州立大學 |
| 26 | 喬丹·法瑪爾(PG) | 美國 | 洛杉磯湖人（來自邁阿密熱隊） | 加州大學洛杉磯分校（UCLA） |
| 27 | 塞爾吉奧·羅德里格斯(PG) | 西班牙 | 菲尼克斯太陽（換去波特蘭開拓者） | Adecco Estudiantes（西班牙） |
| 28 | 莫里斯·艾格(SG) | 美國 | 達拉斯小牛 | 密西根州立大學 |
| 29 | 馬蒂·科林斯(PG) | 美國 | 紐約尼克斯 （來自聖安東尼奧馬刺） | 坦普爾大學 |
| 30 | 喬爾·福里蘭德(PF) | 英格蘭 | 波特蘭開拓者 （來自底特律活塞） | CB Gran Canaria（巴薩籃球隊） |
安德里亞·巴格納尼第二輪
| 順位 | 球員 | 國籍 | 所屬球隊 | 學校/前屬俱樂部 |
| 31 | 詹姆斯·懷特(SG) | 美國 | 波特蘭開拓者（換去印第安那步行者） | 康乃狄克大學 |
| 32 | 史蒂夫·諾瓦克(SF) | 美國 | 休斯敦火箭（來自紐約尼克斯， | 馬克特大學 |
| 33 | 所羅門·瓊斯(C) | 美國 | 亞特蘭大鷹隊 | 南佛羅里達大學 |
| 34 | 保羅·戴維斯(C) | 美國 | 洛杉磯快船（來自夏洛特山貓） | 密西根州立大學 |
| 35 | P.J.塔克 (SF) | 美國 | 多倫多猛龍 | 德克薩斯州大學奧斯汀分校 |
| 36 | 克雷格·史密斯(PF) | 美國 | 明尼蘇達森林狼（來自波士頓凱爾特人） | 波士頓學院 |
| 37 | 鮑比·瓊斯(SF) | 美國 | 明尼蘇達森林狼（換去費城76人） | 華盛頓大學 |
| 38 | 科斯塔·佩羅維奇(C) | 塞爾維亞 | 金州勇士 | 貝爾格勒游擊隊（塞爾維亞、亞得里亞海地區籃球聯賽） |
| 39 | 大衛·諾爾(SF) | 美國 | 密爾沃基雄鹿 （來自休斯敦火箭） | 北卡羅萊納大學 |
| 40 | 德漢·布朗 (SG) | 加拿大 | 西雅圖超音速 | 康乃狄克大學 |
| 41 | 詹姆斯·奧古斯丁(PF) | 美國 | 奧蘭多魔術 | 伊利諾伊大學香檳分校 |
| 42 | 丹尼爾·吉布森(PG) | 美國 | 克里夫蘭騎士（來自費城76人） | 德克薩斯州大學奧斯汀分校 |
| 43 | 馬庫斯·文尼西斯·德·蘇沙 (SF) | 巴西 | 紐奧良黃蜂 | 奧巴傑克蒂沃·聖卡羅斯（巴西） |
| 44 | 里奧·埃利亞胡 (SF) | 以色列 | 奧蘭多魔術 （換去休斯敦火箭選秀權 轉手過密爾沃基雄鹿） | Hapoel Galil Elyon （以色列IBA） |
| 45 | 亞歷山大·詹森(PF) | 美國 | 印第安那步行者（換去孟菲斯灰熊選秀權 轉手過波特蘭開拓者） | 佛羅里達州立大學 |
| 46 | 迪·布朗(PG) | 美國 | 猶他爵士 （來自芝加哥公牛） | 伊利諾伊大學香檳分校 |
| 47 | 保羅·米爾薩普(PF) | 美國 | 猶他爵士 | 路易斯安那科技大學 |
| 48 | 維拉德瑪·威勒明科 (PF) | 白俄羅斯 | 華盛頓奇才 | 聖彼得堡迪納摩籃球俱樂部（俄羅斯） |
| 49 | 里昂·鮑威(PF) | 美國 | 丹佛掘金（換去波士頓凱爾特人） | 加州大學柏克萊分校 |
| 50 | 萊恩·霍林斯(C) | 美國 | 夏洛特山貓（來自薩克拉門托國王） | UCLA |
| 51 | 切克·薩姆布(C) | 塞內加爾 | 洛杉磯湖人（至底特律活塞） | WTC Cornellà（西班牙籃球俱樂部） |
| 52 | 吉勒莫·迪亞茲 (SG) | 波多黎各 | 洛杉磯快船 | 邁阿密大學 |
| 53 | 尤塔姆·海爾普林 (PG) | 以色列 | 西雅圖超音速（來自孟菲斯灰熊） | 斯洛維尼亞和 亞得里亞海地區籃球聯賽 |
| 54 | 哈桑·亞當斯(SG) | 美國 | 新澤西網隊 | 亞利桑那大學 |
| 55 | 艾克·猶波亞 (F) | 奈及利亞 | 克里夫蘭騎士 | 拉格斯聯合銀行籃球俱樂部（奈及利亞） |
| 56 | 埃丁·巴夫切齊 (C) | 波士尼亞和赫塞哥維納 | 多倫多猛龍 （來自邁阿密熱隊）（換去費城76人） | 波赫和 亞得里亞海地區籃球聯賽 |
| 57 | 魯卡斯·馬弗洛克法雷蒂斯 (C) | 希臘 | 明尼蘇達森林狼（來自菲尼克斯太陽） | 薩洛尼卡PAOK籃球俱樂部（希臘） |
| 58 | 達尼洛·平洛克 (SG) | 美國 巴拿馬 | 達拉斯小牛（換去洛杉磯湖人） | 喬治·華盛頓大學 |
| 59 | 達米爾·馬爾科塔 (SF) | 波士尼亞和赫塞哥維納 | 聖安東尼奧馬刺（來自密爾沃基雄鹿） | 克羅埃西亞籃球甲級聯賽和亞得里亞海地區籃球聯賽 |
| 60 | 維爾·布拉洛克 (PG) | 美國 | 底特律活塞 | 俄亥俄州 |
最佳新秀
2006年NBA選秀2006--2007賽季NBA最佳新秀為波特蘭開拓者隊的球員：布蘭登·羅伊。
場均16.8分，4.4籃板，4助攻，1.1搶斷，0.1蓋帽。
第一陣容
安德里亞-巴格納尼，蘭迪-弗耶，魯迪-蓋伊，布蘭頓-羅伊，拉馬庫斯-阿爾德里奇，約格-加巴約薩。
安德里亞-巴格納尼：場均：11.6分，3.9籃板，0.8助攻，0.5搶斷，0.8封蓋。
蘭迪-弗耶：場均：10.1分，2.7籃板，2.8助攻，0.6搶斷，0.3封蓋。
魯迪-蓋伊：場均：10.8分，4.5籃板，1.3助攻，0.9搶斷，0.9封蓋。
布蘭頓-羅伊：場均：16.8分，4.4籃板，4.0助攻，1.2搶斷，0.2封蓋。
拉馬庫斯-阿爾德里奇：場均：9.0分，5.0籃板，0.4助攻，0.3搶斷，1.2封蓋。
約格-加巴約薩：場均：8.5分，4.9籃板，1.9助攻，1.2搶斷，0.2封蓋。
第二陣容
保羅-米爾薩普，亞當-莫里森，克雷格-史密斯，泰魯斯-托馬斯，沃爾特-赫爾曼。
保羅-米爾薩普：場均：6.8分，5.2籃板，0.8助攻，0.8搶斷，0.9封蓋。
亞當-莫里森：場均：11.8分，2.9籃板，2.1助攻，0.4搶斷，0.1封蓋。
克雷格-史密斯：場均：7.4分，5.1籃板，0.6助攻，0.6搶斷，0.2封蓋。
泰魯斯-托馬斯：場均：5.2分，3.7籃板，0.6助攻，0.6搶斷，1.1封蓋。
沃爾特-赫爾曼：場均：9.2分，2.9籃板，0.5助攻，0.4搶斷，0.1封蓋。
年齡限制
過去曾有許多年輕球員在高中學業結束後選擇直接挑戰NBA舞台，其中也有不少好手在NBA闖出名號，只不過，從05年起，這樣的情形將成為歷史記憶。以往只要球員年滿18歲便可參加NBA選秀，但根據新版NBA選秀年齡限制規定，現在球員必須年滿19歲才具備參加選秀的資格。如此一來，許多完成高中學業的18歲球員將必須選擇到大學待一年或到海外磨練身手，等到符合年齡限制後再挑戰NBA舞台。NBA之所以修訂選秀年齡限制規定，主要是希望減少高中畢業生在還沒有決定好是否要經歷NCAA賽事洗禮後就貿然挑戰NBA選秀，如果這樣的情形持續擴大，NBA賽事的精彩程度勢必也將大打扣。
2004年選秀時，前19順位中有8名高中跳級生獲得NBA球隊們的青睞，其中霍華德以選秀狀元身份加盟魔術陣營，肖恩-利文斯頓也以選秀第四順位資格穿上快艇戰袍。NBA選秀前45順位中有6名高中畢業生被球隊看上，開拓者用第六順位選秀權挑了馬泰爾-韋伯斯特，爵士則以第34順位選秀權選了C.J.邁爾斯，高中跳級生獲得NBA球隊喜愛的情形可見一斑。然而，NBA官方卻認為，如果讓這樣的情況繼續發展下去，勢必會有無法收拾的一天，因此，NBA總裁斯特恩才堅持要NBA的球探們離開高中校園。雖然新版選秀年齡限制規定引發不少反彈聲浪，但國王總經理喬夫-皮特里卻認這是個不錯的決定，“老實說，我還蠻贊同這樣的作法。我們的確看過像詹姆斯這樣出色的高中跳級生，但那畢竟是少數……”
選秀抽籤
2006年NBA選秀抽籤2003年NBA選秀現場相關圖片NBA主管人員委員會於1984年6月在鹽湖城舉行會議，當時他們投票決定無緣進入季後賽的球隊選擇第一輪新秀的順序。這一制度始於1985年。而在此之前的1966－1984年之間，東西部戰績最差的球隊將通過拋硬幣決定誰獲得首先選秀的權力。在NBA選秀抽籤當中，常規賽戰績最差的球隊最有可能獲得第一選秀權，而無緣進入季後賽的球隊中戰績最佳的則機會最小。抽籤將決定最先三支球隊的選擇權順序而已，而剩下的無緣進入季後賽的球隊則按照常規賽的戰績倒序進行選擇。在抽籤儀式中，主持人會把編號為1－14號的14個桌球放在一個鼓型容器中。從14個球中隨意抽出4個球可以產生1001種可能的組合情況，這當中不考慮選擇的先後。在抽籤之前，參加抽籤的球隊按照他們的常規賽排名獲得1000種組合情況。4個桌球會被依次抽到容器的頂部以組成一個四位數的組合，獲得這一組合的球隊將獲得頭號選秀權。隨後，這4個桌球將被送回容器底部，隨後再重複之前的情況以決定二號和三號選秀權誰屬。如果抽出的組合情況不在分配的範圍之內，那么抽籤將重新進行。
