位置
該站位於京承高速公路同太陽宮路交匯口。13號線車站在京承高速中央，呈西南-東北走向布置，10號線車站在交匯口以東，呈東西走向布置，位置都偏北。
結構
芍藥居站站內立體圖（13號線）13號線部分為2層地上車站，側式站台設計；10號線部分為2層地下車站，島式站台設計。總長183.4m，寬38.84m，總建築面積12500㎡。出入口3個，疏散通道1個。
芍藥居站車站南側設定了一個1500平方米的腳踏車停車場，北側設定了一個將近2000平方米的腳踏車停車場。此外，車站提供約50個車位的停車場。
換乘
芍藥居站10號線車站與13號線車站之間通過一條長65.95米的地下通道連線。地下通道從捷運10號線芍藥居站最西側開始，向西穿過京承高速公路東側半幅後，與捷運13號線的芍藥居站相連。乘客步行兩三分鐘就能實現快速換乘。
出入口
芍藥居站該站共有5個出口：13號線2個：A（西）、B（東）；10號線3個：E（西北）、F（東北）、G（西南）。
首末車時間
13號線
開往西直門：5:42-22:49（全程）-23:52（終點站回龍觀）
開往東直門：5:19-23:30（全程）
10號線
外環：6:12-22:11（全程）-23:56（車道溝）
內環：5:18-20:47（全程）-22:32（巴溝）-22:52（宋家莊）
公交換乘
13號線
A口：119、 547、 942、 專22
B口：942、 547
10號線
F口：515、567、547、 942
E口：119、547、942快、專22
G口：無
臨近車站
| 下行 | 線路 | 上行 |
| 開往西直門站 （下一站：望京西站） 距離2152米 | 13號線 | 開往東直門站 （下一站：光熙門站） 距離1110米 |
| 內環 （下一站：太陽宮站） 距離1003米 | 10號線 | 外環 （下一站：惠新西街南口站） 距離1712米 |
