主要職責
玉樹州水利局主要職責：（一）貫徹有關水利工作的法律法規和方針政策，擬訂本地區水利發展中長期規劃及年度計畫並組織實施；參與擬訂州管主要流域的防治規劃和防洪規劃；負責提出全州水利固定資產投資規模、方向和財政性資金安排的意見；按規定許可權審批、核准規劃內和年度計畫規模內水利固定資產投資項目。
（二）實施水資源的統一監督管理。組織開展水資源調查評價工作和水能資源調查、規劃管理工作；負責州內主要流域、區域以及水利工程的水資源調度；組織實施取水許可、水資源有償使用制度和城鄉規劃及各類建設項目的水資源論證、防洪論證制度。
（三）負責全州水資源保護和節約用水工作。擬訂水資源保護規劃；組織水功能區的劃分；監測全州江河湖庫的水量、水質，審定水域納污能力；提出限制排污總量的意見。指導飲用水水源保護工作；指導地下水開發利用和城市規劃區地下水資源管理保護工作。組織實施節約用水政策、措施、規劃和相關標準，推動節水型社會建設工作。
（四）指導全州水利基礎設施、水域及其岸線的管理與保護，負責州管河流湖泊及河岸灘涂的治理、開發建設，指導和監督水利工程建設與運行管理。
（五）指導全州水土保持工作。研究制定水土保持的工程規劃並組織實施；組織實施水土流失的監測和綜合防治。指導重點水土保持及有關生態建設項目的實施。組織開展水土保持宣傳教育工作。
（六）指導農村牧區水利工作。組織協調農田、草原水利基本建設，指導農村牧區人畜飲水工程、節水灌溉工程的建設與管理，指導農村牧區水利設施管理和社會化服務體系建設。組織實施小水電建設管理和鄉鎮供水工作。
（七）負責重大涉水違法事件的查處。協調、仲裁跨縣水事糾紛，指導水政監察和水政執法。依法負責水利行業安全生產工作，負責對州管水庫水電站大壩的安全監管，負責水利建設市場的監督管理。
（八）組織、協調、指揮全州防汛抗旱工作。指導水利突發公共事件的應急管理工作。
（九）按規定許可權，負責全州水利工程建設項目招標投標活動的監督與管理；組織開展水利行業質量監督工作，執行水利行業的技術標準；承擔水利科技推廣和水利統計工作。
（十）組織指導河道采砂管理工作。
（十一）承辦州政府交辦的其他事項。
機構設定
玉樹州水利局設4個內設機構：（一）辦公室。
負責文電、會務、機要、檔案等機關日常事務工作。承擔信息、保密、信訪、政務公開、政府部門間的聯繫協調與督查督辦等工作；負責局機關財務報賬、水利統計報表及有關其他報表和人事工作。
（二）規劃計畫建設科。
起草水利規劃，審核州管建設項目洪水影響評價和水利工程建設規劃意見書，組織審核州管水利工程項目建議書和可行性研究報告。組織州管水利建設項目初步設計審核和工程建設與驗收；指導州內水利工程建設管理；指導州管水利工程開工審批、蓄水安全鑑定和驗收；組織協調全州農田、草原水利基本建設工作；指導農村牧區飲水安全、村鎮供排水工作；指導實施農村牧區飲水安全工程建設；指導農田灌溉與草原灌溉工作；組織實施節水灌溉、雨水積蓄利用、灌區續建配套與節水改造、草原節水灌溉示範項目、泵站建設與改造工程建設；組織實施小型農田水利工程建設；指導水利建設市場的監督管理；承擔州內水利科技項目和科技成果的管理工作；承擔州管水利水電工程建設項目招投標活動監督管理，承擔州管水利工程質量監督管理。
（三）水政水資源科。
負責水資源調查、評價和監測工作；編制水資源專業規劃並監督實施；監督實施水資源論證制度、取水許可制度和水資源有償使用制度；組織編制節約用水規劃，監督實施各行業用水定額；承擔地下水資源開發利用和保護工作；指導州管水電站大壩的安全監管，組織重大水利安全事故的調查，指導水利基礎設施、水域及其岸線的保護與管理；指導河流、湖泊及河岸的治理開發，組織指導河道采砂管理及河道範圍內建設項目管理的有關工作；指導水政監察和水行政執法工作；指導州管河流水能資源開發、小水電建設及管理工作。
（四）水利水土保持科。
承擔水土流失綜合防治；組織編制水土保持規劃並監督實施；負責開發建設項目水土保持方案的審核並監督實施；組織水土流失監測、預報並公告；組織實施水土保持的宣傳教育工作。
