擁有鳳起東路院本部、復興路測繪院、六堡試驗基地和江東農水試驗基地等多處辦公、試驗場所。具有不同專業、不同等級的各類資質30項，其中工程諮詢、工程勘察、建設監理、大中型水庫大壩安全評價、水土保持監測、海洋測繪等甲級資質13項，乙級資質7項，丙級資質8項、其他2項。
設有河口海岸研究院、錢塘江研究中心、防災減災研究所、水資源水環境研究所、農村水利研究所、岩土工程研究所、水土保持研究所、環境評價研究中心、自動化信息技術研究所等科研業務部門，以及浙江省河海測繪院、浙江廣川工程諮詢有限公司、杭州廣川科技有限公司、深圳分院等科技服務單位。同設國際泥沙研究培訓中心杭州河口海岸實驗研究基地、浙江省河口海岸重點實驗室、浙江省水利防災減災重點試驗室、博士後科研工作站、浙江省水利水電工程質量監督檢驗站、浙江省水庫大壩安全監測中心、浙江省灌溉試驗中心站、浙江省水電測試中心、水利部浙江省檢索查新工作站、浙江省水利廳科技情報站、《浙江水利科技》編輯部等機構。
建院五十多年來，研究院廣泛開展科學研究和科技服務，為經濟社會發展提供了強有力的科技支持。先後參與杭州灣跨海大橋、秦山核電站等一批特大型工程的前期可研、規劃、選址、工可等科技諮詢工作，服務領域涵蓋了水利、農業、水產、海洋、交通、能源、環境、城鄉建設等國民經濟建設各個領域，服務對象投資總量超過5000億元。先後榮獲全國水利文明單位、全國水利科技工作先進集體、浙江省文明單位、全國農林水利系統“模範職工之家”等榮譽稱號。多人獲得勞動模範、“五一”勞動獎章、農業推廣先進個人、青年科技英才等榮譽。
通過多年的積累與提升，研究院科研領域不斷擴大，水平不斷提高，多項研究成果獲國內領先水平，錢塘江強潮河口的治理開發研究已達到國際先進水平。，共榮獲廳級以上科技進步獎211項，其中國家和省部級科技進步獎77項，發表論文1800多篇，撰寫、出版專著19本。完成了國家、浙江省自然科學基金、水利部“948”、水利部公益性行業科研專項、農業部科技成果轉化等一大批重大項目的科學研究任務，為浙江省社會經濟發展做出了應有的貢獻。
