背景
1864年，新疆各族人民在陝甘回民起義的影響下，紛紛發動反清起事，先後建立起幾個互不相屬的封建割據政權。這些政權均為當地宗教和民族上層分子所掌握，彼此間互相攻伐。煽動民族仇殺，新疆處於紛爭不己的戰亂之中。
過程
1864年8月，柯爾克孜族人思的克雖奪取喀什噶爾的回城疏附，但漢城疏勒卻久攻不下，於是派回族封建主金相印赴中亞的浩罕國（今烏茲別克斯坦共和國境內）“請援”，浩罕統治者派帕夏（陸軍司令）阿古柏於1865年初率軍侵占喀什噶爾，驅逐了思的克。此後兩年間，阿古柏又先後攻占南疆各城，吞併了其他幾個割據政權。1867年，阿古柏悍然宣布成立“哲德沙爾汗國”（意為七城汗國，即喀什噶爾、莎車、和田、庫車、葉爾羌、阿克蘇、吐魯番），自稱“畢條勒特汗”（意為“幸運者”）。1870年，又將侵略勢力擴張到北疆，相繼侵占吐魯番盆地和烏魯木齊等地。阿古柏以外族入侵新疆，對各族人民進行殘酷野蠻的壓迫與統治，給新疆人民帶來了深重的災難。
當時正在中亞進行激烈爭奪的英國和沙俄，都試圖通過支持阿古柏政權，染指中國新疆地區，從而使新疆的局勢更加複雜、嚴重。
