加長版特輯
簡介
一般指《名偵探柯南》的動畫TV版中偶爾播出的長度超過一般劇集（30分鐘）的電視特輯，簡稱為SP，算入電視動畫集數中。《名偵探柯南》TV版正集中已經播出了30集加長版特輯，其中20個一小時特輯，8個二小時特輯，2個兩個半小時特輯。
由於2009年4月起《名偵探柯南》TV版動畫播放時間進行了更改，節目時間更加緊張，因此無法再隨意延長時間來播放加長版特輯。所以加長版特輯從TV 522之後幾乎絕跡（之後至今僅TV 651為加長版特輯。TV 651播出時占用了另一節目時間，因此播出後下一周柯南動畫進行公休來對其進行補償。
| 序號 | 集數 | 名稱 | 播放時間 | 時長 | 收視率 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 11 | 鋼琴奏鳴曲『月光』殺人事件 | 1996年4月8日 | 1小時 | 12.9% |
| 2 | 52 | 霧天狗傳說殺人事件 | 1997年3月17日 | 1小時 | 17.9% |
| 3 | 76 | 柯南對怪盜基德 | 1997年9月22日 | 1小時 | 21.7% |
| 4 | 96 | 走投無路的名偵探 連續兩大殺人事件 | 1998年3月23日 | 2小時 | 22.4% |
| 5 | 118 | 浪花連續殺人事件 | 1998年9月21日 | 1小時 | 21.2% |
| 6 | 129 | 黑暗組織來的女子 大學教授殺人事件 | 1999年1月4日 | 2小時 | 20.9% |
| 7 | 162 | 飛天密室 工藤新一最初的事件 | 1999年9月27日 | 1小時 | 19.8% |
| 8 | 174 | 二十年後的殺機 交響樂號連續殺人事件 | 2000年1月3日 | 2小時 | 14.6% |
| 9 | 184 | 詛咒假面的冷笑 | 2000年3月13日 | 1小時 | 20.1% |
| 10 | 208 | 通往迷宮的入口 巨大神像的憤怒 | 2000年10月9日 | 1小時 | 18.6% |
| 11 | 219 | 名偵探齊聚一堂 工藤新一VS怪盜基德 | 2001年1月8日 | 2小時 | 17.6% |
| 12 | 263 | 大阪雙重疑案 浪花劍客與太閤城 | 2002年1月7日 | 2小時 | 19.5% |
| 13 | 304 | 震撼警政廳 1200萬人質 | 2003年1月6日 | 2小時 | 17.0% |
| 14 | 342 | 豪斯登堡的新娘 | 2003年11月17日 | 1小時 | 12.9% |
| 15 | 345 | 與黑色組織面對面 滿月之夜的兩起神秘事件 | 2004年1月5日 | 2.5小時 | 16.7% |
| 16 | 356 | 怪盜基德令人驚異的空中漫步 | 2004年4月12日 | 1小時 | 13.7% |
| 17 | 383 | 甲子園的奇蹟 向無形的惡魔挑戰 | 2004年12月20日 | 2小時 | 12.5% |
| 18 | 425 | 黑色衝擊 組織之手逼近的瞬間 | 2006年1月9日 | 2.5小時 | 13.1% |
| 19 | 449 | 總局警官戀愛物語 虛假的結婚典禮 | 2006年8月21日 | 1小時 | 11.8% |
| 20 | 452 | 金昆羅劇場魅影 | 2006年9月11日 | 1小時 | 9.1% |
| 21 | 479 | 與服部平次共度的三天 | 2007年7月16日 | 2小時 | 10.5% |
| 22 | 487 | 本廳警官戀愛物語8 左手的無名指 | 2007年10月15日 | 1小時 | 10.9% |
| 23 | 488 | 電視台的惡魔 | 2007年10月22日 | 1小時 | 9.4% |
| 24 | 489 | 法庭的對決3 檢察官是目擊者 | 2007年11月26日 | 1小時 | 10.1% |
| 25 | 490 | 服部平次VS工藤新一 滑雪場的推理對決 | 2007年12月3日 | 1小時 | 8.8% |
| 26 | 515 | 怪盜基德的瞬間移動魔術 | 2008年10月20日 | 1小時 | 9.6% |
| 27 | 516 | 風林火山 迷宮的鎧甲武士 | 2008年11月3日 | 1小時 | 10.8% |
| 28 | 521 | 殺人犯 工藤新一 | 2009年1月19日 | 1小時 | 9.6% |
| 29 | 522 | 新一的真實身份和小蘭的眼淚 | 2009年1月26日 | 1小時 | 11.3% |
| 30 | 651 | 柯南VS平次 東西偵探推理對決 | 2012年3月24日 | 1小時 | 10.3% |
| 註： | 516風林火山 迷宮的鎧甲武士，這集的特輯故事並沒有結束，風林火山的故事是517風林火山 陰影和雷光的對決結束 | ||||
分集劇情
TV11《鋼琴奏鳴曲『月光』殺人事件》一小時特別篇
日文標題：ピアノソナタ「月光」殺人事件
對應漫畫：Vol.7 File.2-File.7
播映時間：1996年4月8日
劇情簡介：毛利一行人受到已故的麻生圭二先生的邀請前往月影島。可是自從上屆村長的追悼會舉行後，兇殺案便在《月光》奏鳴曲的伴奏下一件接一件的展開，川島先生、黑原村長相繼被害，鋼琴奏鳴曲《月光》成為案件的主要線索，到底誰才是殺人兇手呢？
特輯2
TV 52《霧天狗傳說殺人事件》一小時特別篇
對應漫畫：Vol.11 File.8-File.10
播映時間：1997年3月17日劇情簡介：江戶川柯南、毛利蘭、毛利小五郎在一間寺院借宿時，發現一個和尚懸樑自盡了。在這個寺院中流傳著一個霧天狗的傳說，和尚的死法簡直就像被霧天狗殺死一樣，2年前雖然也發生過同樣的事情，但是警察卻認定為自殺。但是，對自殺的觀點保有懷疑態度的柯南，準備迎接這個天大詭計的挑戰…
特輯3
TV 76《柯南對怪盜基德》一小時特別篇
日文標題：コナンVS怪盜キッド
對應漫畫：Vol.16 File.6-File.9
播映時間：1997年9月22日劇情簡介：鈴木家收到了怪盜基德發出的要來偷取將在米花博物館展出的黑珍珠“黑暗星辰”的預告函。柯南解讀了預告函向怪盜基德的現身地衝去。其後，基德又發出一封要在遊艇宴會上偷取“黑暗星辰”的預告函…
特輯4
TV 96《走投無路的名偵探 連續兩大殺人事件》二小時特別篇
日文標題：追いつめられた名探偵！連続2大殺人事件
對應漫畫：Vol.14 File.1-File.8
播映時間：1998年3月23日
劇情簡介：魔術師九十九元康的妻子來到毛利偵探事務所。她覺得一個星期前被認為自殺的丈夫是不可能自殺的，希望小五郎儘快調查現場…柯南在那裡看到了有暗號的memo和被牌遮住的電話推理出了真正的犯人。蘭在看到以前的影集時發現柯南和新一小時候一模一樣。相信柯南就是新一所以把柯南帶到了新一家門口！正在這個時候有希子回來了。次日柯南和有希子一起去了有希子的同學數內家，那裡正在為了遺產起紛爭。這次解決案件的卻是…
特輯5
TV 118《浪花連續殺人事件》一小時特別篇
對應漫畫：Vol.19 File.5-File.8
播映時間：1998年9月21日
劇情簡介：本來是應服部平次之邀來大阪參觀的柯南、小蘭、大叔卻意外地捲入到連續殺人事件中。屍體墜落到柯南他們乘坐的巡邏車上。據稱這是連續殺人事件的第三個受害者的屍體。還有，從事件現場離開的中年女性也以相同手法被人殺害…
特輯6
TV 129《黑暗組織來的女子 大學教授殺人事件》二小時
日文標題：黒の組織から來た 女大學教授殺人事件
對應漫畫：Vol.18 File.6-Vol.19 File.1
播映時間：1999年1月4日
劇情簡介：柯南的班級轉來了灰原哀。隔壁班級的一個男孩因為哥哥下落不明而來委託少年偵探團。尋找的時候發現了一個黑衣女子的身影…那個組織的真面目到底是？然後，博士和灰原和柯南去廣田教授家拿軟碟，可是…
特輯7
TV 162《飛天密室 工藤新一最初的事件》一小時特別篇
日文標題：空飛ぶ密室！工藤新一最初の事件
對應漫畫：Vol.21 File.4-File.7
播映時間：1999年9月27日
劇情簡介：阿笠博士抽獎抽中了旅行券，於是小五郎、小蘭和偵探團去了沖繩，在飛機上小蘭夢見了以前和新一一起去洛杉磯時在飛機上發生的殺人事件。那么這就是新一最初的一頁…
特輯8
TV 174《二十年後的殺機 交響樂號連續殺人事件》二小時特別篇
日文標題：20年目の殺意 シンフォニー號連続殺人事件
對應漫畫：Vol.23 File.4-File.9
播映時間：2000年1月3日
劇情簡介：小蘭看到去小笠原參加免費海豚旅行的廣告之後，報名參加了。乘客中據說有當年蛟崎警官追捕過的影子計畫師葉才三。服部收到了叫“古川大”的人寄來的信，也參加了這個旅行團。後來船上發生了爆炸，那個被燒死的男人是…？並且企圖解開謎題的平次也被人襲擊了。
特輯9
TV 184《詛咒假面的冷笑》一小時特別篇
日文標題：呪いの仮面は冷たく笑う
對應漫畫：動畫原創
播映時間：2000年3月13日
劇情簡介：毛利一行人去參加為了交通事故的孤兒們的慈善活動，被邀請到發起者的社長家裡。社長蘇芳紅子在收集面具。連被稱作被詛咒的假面的面具也用來裝飾。為了不讓這些面具出來作怪，晚上0點就會把這件假面之屋鎖掉。當天晚上蘇芳紅子在自己的臥室被殺害，臥室上了兩道鎖，處於密室狀態。同時在蘇芳紅子的屍體周圍被詛咒的假面散落了一地。這真的是詛咒嗎？
特輯10
TV 208《通往迷宮的入口 巨大神像的憤怒》一小時特別篇
日文標題：迷宮への入り口 巨大神像の怒り
對應漫畫：動畫原創
播映時間：2000年10月9日
劇情簡介：柯南、小蘭、大叔被邀請參加天部山纜車的揭幕儀式，然而當地居民中，反對纜車開通的呼聲不絕。第二天開幕式，在進入漆黑的通道的纜車中，堂本觀光的社長突然消失了。出了通道，纜車上的眾人發現社長的屍體出現在神像的手中…
特輯11
TV 219《名偵探齊聚一堂 工藤新一VS怪盜基德》二小時特別篇
日文標題：集められた名探偵！工藤新一vs.怪盜キッド
對應漫畫：Vol.30 File.4-File.7
播映時間：2001年1月8日
劇情簡介：打算盜取鈴木財閥家的黑珍珠“漆黑之星”的怪盜基德，想起了以前關於鍾台的一個事件，那是工藤新一和怪盜基德的第一次交手。
另一方面，小五郎的事務所里收到不明發信人的信函，而且裡面裝著支票。小五郎帶著小蘭、柯南一起到了“黃昏之館”。“黃昏之館”是大富翁烏丸蓮耶的別墅，一同被招待的還有其他名偵探。而後開始了在館中尋找財寶的遊戲，但偵探們一個一個消失，最後留下來的偵探是誰？召集偵探們的犯人的真實身份是…
特輯12
TV 263《大阪雙重疑案 浪花劍客與太閤城》二小時特別篇
日文標題：大阪ダブルミステリー 浪花剣士と太閤の城
對應漫畫：Vol.31 File.8-Vol.32 File.4
播映時間：2002年1月7日
劇情簡介：浪花的體育館正在舉行高中、大學劍道部的地區比賽。服部平次的改方學院是優勝的候補隊。而新內大的垂水在體育館的倉庫內被殺害。平次挑戰垂水之死的謎團。
來大版觀光的柯南與平次一行偶遇秀吉愛好會旅行團（糟屋、福島、片桐、脇坂）。然而其中的一人，加藤在天守閣出燃燒並墜落。加藤緊握著平次的傘而死亡。
特輯13
TV 304《震撼警政廳 1200萬人質》二小時特別篇
日文標題：揺れる警視庁 1200萬人の人侃
對應漫畫：Vol.36 File.8-Vol.37 File.1
播映時間：2003年1月6日
劇情簡介：處理郵局強盜事件後，佐藤刑事想起了3年前的連續炸彈事件。忘不了用自己的生命來換取炸彈所在地點的松田刑事。然而，與3年前同一天的11月6日，又收到炸彈預告的傳真。發信人似乎與3年前連續炸彈事件的犯人是同一人。佐藤、高木刑事與少年偵探團開始從傳真的文字內容推理炸彈的地點。
特輯14
TV 342《豪斯登堡的新娘》一小時特別篇
日文標題：ハウステンボスの花嫁
對應漫畫：動畫原創
播映時間：2003年11月17日
劇情簡介：由於受園子的邀請柯南和蘭為了要出席大賀財團繼承人大賀真哉的結婚酒宴乘新幹線去了豪斯登堡。在途中柯南一行人遇上了做玻璃小酒杯的員工高橋純一。但是第二天的結婚儀式前發生了新娘的化裝間裡的大賀家家寶紅寶石戒指失蹤事件。還有新娘香取茜也不知道被誰綁架了…
特輯15
TV 345《與黑色組織面對面 滿月之夜的兩起神秘事件》兩個半小時特別篇
日文標題：黒の組織と真っ向勝負 満月の夜の二元ミステリー
對應漫畫：Vol.42 File.5-File.10
播映時間：2004年1月5日
劇情簡介：毛利蘭收到暗示有殺人預告的萬聖節晚會邀請函的小五郎和園子兩個人去了晚會會場。另一方面、新一同樣收到了一份一樣的邀請函。而且新一和柯南是同一個人也漸漸暴露了。柯南用麻醉槍讓拚命阻止哀睡著了。在幽靈船會場上扮成亡靈船長的舉辦人是某遊戲開始了。但是發生了舉辦者被殺事件。與此同時，朱蒂出現在被一個人留在家裡的哀的面前，而新出醫生的真實身份是…
特輯16
TV 356《怪盜基德令人驚異的空中漫步》一小時特別篇
對應漫畫：Vol.44 File.7-File.10
播映時間：2004年4月12日
劇情簡介：園子的親戚，鈴木財閥的顧問鈴木次郎吉在報紙上發出了一張給基德的挑戰書。讓他來盜取大寶石“大海的奇蹟”…基德接受了挑戰，說他前一天會演一齣好戲。驚慌失措的警察們戒備森嚴，就在這種情況下，基德登場了！幸運女神到底會向誰微笑，是偵探，還是怪盜？
特輯17
TV 383《甲子園的奇蹟 向無形的惡魔挑戰》二小時特別篇
對應漫畫：Vol.43 File.10-Vol.44 File.3
播映時間：2004年12月20日
劇情簡介：柯南一行人受平次之邀去甲子園觀看夏季高中棒球聯賽。但他們偶然拾得了一部電話，對方告知在第三回合、第六回合與第九回合比賽結束前，若不找到放在其餘地方的手機，他就引爆炸彈自殺。這時一條簡訊又顯示出了手機所在地點的暗號。柯南與平次能在坐滿5萬名觀眾的甲子園球場中找到這名放炸彈的男人嗎？
特輯18
TV 425《黑色衝擊 組織之手逼近的瞬間》兩個半小時特別篇
日文標題：ブラックインパクト！組織の手が屆く瞬間
播映時間：2006年1月9日
劇情簡介：小五郎在與播音員水無怜奈的對話中得知她被惡作劇的門鈴所困擾一事，便與柯南及蘭一同前往怜奈的家。
小五郎等人雖然抓到了犯人，但此時，柯南卻從安裝的竊聽器中覺察到怜奈實際是黑衣組織同黨一事。
隨後，黑衣組織制定了於下午1點在代號為ADP的地點暗殺一個代號為DJ的人的計畫。密切關注著怜奈的FBI探員茱蒂決定與柯南聯手阻止暗殺計畫。為了阻止暗殺計畫，就要知道ADP和DJ的意思是什麼，柯南隨即展開了推理…
特輯19
TV 449《總局警官戀愛物語 虛假的結婚典禮》一小時特別篇
日文標題：本庁の刑事戀物語 偽りのウエディング
對應漫畫：Vol.52 File.3-File.5
播映時間：2006年8月21日
劇情簡介：小五郎，柯南，蘭在東都迎賓館出席完婚禮後，在走廊碰見新郎打扮的高木刑警和新娘打扮的由美。其實，兩人是被強盜當作目標的新娘和新郎的替身。據說半年前，強盜潛入新娘的娘家，被新郎趕走的強盜在逃跑時留下了絕對不能忘記這份仇恨的恐嚇。
從被留下的菜刀驗出的指紋與連奪6條人命的連續盜竊殺人案罪犯的指紋相吻合，前天，充滿恐嚇意思的威脅信被人放入了新娘家的信箱裡。之後，在堤無津川的倉庫發現了被割喉焚燒的屍體，從燃燒殘留下的指甲上驗出了強盜的指紋…
特輯20
TV 452《金昆羅劇場魅影》一小時特別篇
日文標題：こんぴら座の怪人
對應漫畫：動畫原創
播映時間：2006年9月11日
劇情簡介：小五郎、柯南、小蘭、園子為了看伊東玉之助的劇團的戲劇表演，而前往了有名的劇院：金丸座，與玉之助、蓮華，惠美等人再次相見。這次，劇團上演的是以《劇場魅影》為藍本改編的《金昆羅劇場魅影》的時代劇，玉之助飾演怪人，女演員輕部蘆美飾演女主角歌手。這之後，在彩排中大吊燈突然落下，由於蘆美額頭受了小傷，玉之助不得不在劇院，公開了被實際存在的怪人要求更換女主角的事情。原來團長已經收到了“換女主角，換蓮華！”的恐嚇信…
特輯21
TV 479《與服部平次共度的三天》兩小時特別篇
日文標題：服部平次との3日間
對應漫畫：Vol.54 File.6-Vol.55 File.2
播映時間：2007年7月16日
簡介：柯南、小蘭、服部平次、遠山和葉乘坐小五郎駕駛的租賃車來到觀賞櫻花的著名景點。在這裡，一位叫傅久的年輕修行僧在發現小五郎後很吃驚。原來傅久希望小五郎可以替他揭開一個謎團。據傅久講，前幾天，前來拜訪和尚的一名女性從房間消失了。小五郎等人拜訪寺院，柯南和平次決定弄清真相…
次日清晨，平次向柯南等人說出了自己即將出演，由日賣電視台企劃的偵探甲子園的事情。據說將聚集全國的高中生偵探，決出日本第一的企劃，自己將作為西部代表登場。柯南也作為平次的助手參加了在無人島舉行的偵探甲子園，這時白馬探也出現了！
特輯22
TV 487《本廳警官戀愛物語8 左手的無名指》一小時特別篇
日文標題：本庁の刑事戀物語 左手の薬指
對應漫畫：Vol.56 File.1-File.3
播映時間：2007年10月15日
劇情簡介：走在警視廳的佐藤刑警被眾多同事紛紛注視著。此後，高木刑警被白鳥警長質問佐藤刑警所帶戒指的事情。此時，佐藤的手機響起。高木完全沒有搞清楚是怎么回事，而將視線望向佐藤，第一次注意到她左手無名指上戴著戒指。高木認為只有訂婚的人，才在左手無名指上佩戴戒指，備受打擊。同事們則誤認為是高木贈送的婚約戒指，而高木堅決否認是自己贈送的。就在此時，佐藤接到了小蘭打來的說有人死亡的電話。佐藤立刻決定和高木趕往現場。但是，高木太在意佐藤的戒指，一時沒有反應過來…
特輯23
TV 488《電視台的惡魔》一小時特別篇
日文標題：テレビ局の悪魔
對應漫畫：Vol.57 File.5-File.7
劇情簡介：柯南、少年偵探團、灰原和阿笠博士去日賣電視台參觀假面超人的拍攝。然而，由於拍攝的時間延遲了，於是柯南等人只好改為參觀電視台。在電視台里，他們恰巧遇見了“三途之III”的主唱撒旦鬼冢。鬼冢離開後，光彥才想起姐姐拜託自己問鬼冢要簽名的…柯南等人想法設法尋找鬼冢的休息室，終於，光彥順利得到了簽名。此時，AD三島突然面色慘白的跑進休息室、把鬼冢一行人帶到了會客室。原來，鬼冢所屬的藝人事務所社長---漆原典兒在會客室里被害了…
特輯24
TV 489《法庭的對決3 檢察官是目擊者》一小時特別篇
日文標題：法廷の対決III 目撃者は検察官
對應漫畫：動畫原創
播映時間：2007年11月26日
劇情簡介：東京拘留所的接見室內，妃英理律師與嫌疑人竹內浩明會面。竹內因在酒鋪喝了酒後，用車撞上了受害者，之後逃逸。擔任此案公訴的九條檢察官認為應對竹內處以10日拘留。妃律師問訊了不被釋放的原因，但竹內什麼也沒回答。一方面，小五郎，柯南，蘭為了協助妃律師，前往警察署對事故車輛進行調查。觀察了車內布局的柯南對駕駛座位狹小的空間存在很大疑問。如果是男性的竹內坐在上面的話，太過於狹小了。據辦事員講，九條檢察官也注意到了座位的狹小問題。此後，小五郎等人從目擊事故的出租汽車司機那裡問清了事故的經過。根據司機回憶，現場查證的時候，九條檢察官認為存在犯人是女性的可能性…
特輯25
TV 490《服部平次VS工藤新一 滑雪場的推理對決》一小時特別篇
日文標題：服部平次vs工藤新一 ゲレンデの推理対決
對應漫畫：Vol.50 File.8-Vol.51 File.1
播映時間：2007年12月3日
劇情簡介：成為柯南的工藤新一給在大阪的服部平次打手機聊天，由於柯南這個月解決的案件比平次多一件而稍微炫耀了下。於是，平次打斷了新一打算繼續探討案件的念頭，卻回想起3年前滑雪場的事件…
3年前，平次與和葉所在的改方學園國中部來到山形縣的滑雪場。和葉從同學那裡聽到這座山上有雪女的民間傳說。故事裡，雪女對男人提出用銀色衣服和重要的東西進行交換，結果男人的心臟被奪走的銀衣傳說。據說4年前發生了與民間故事很相似的事件。此後，在滑雪場又發生了和民間故事相似的事件，平次與謎樣的國中生偵探的推理交戰開始了…
特輯26
TV 515《怪盜基德的瞬間移動魔術》一小時特別篇
日文標題：怪盜キッドの瞬間移動魔術
對應漫畫：Vol.61 File.1-File.4
播映時間：2008年10月20日
劇情簡介：園子的叔叔鈴木財團的諮詢顧問次郎吉，計畫用傳說中的拖鞋紫紅趾甲當誘餌，來抓捕基德。次郎吉打算利用基德每次總是從高處出現這一登場方式，來作點文章。次郎吉在東京銀座的十字路口舉辦拖鞋的展示活動。這是個基德不能用滑翔機起飛的地點。隨後，柯南等人隨著民眾的目光，凝視著空中，高空中出現了駕駛滑翔機而來的基德。基德剛在展示台上站穩，次郎吉就對工作人員下達指示，將十字路口的四周用網圍了起來。網的高度達到了20米左右，次郎吉確信自己獲得了勝利，但基德在拿起拖鞋後，宣稱自己將使用瞬間移動的方式進行逃脫。
特輯27
TV 516《風林火山 迷宮的鎧甲武士》 一小時特別篇
日文標題：風林火山 迷宮の鎧武者
對應漫畫：Vol.59 File.5-File.10
播映時間：2008年11月3日
劇情簡介：小五郎和柯南、小蘭拜訪居住在長野縣的一戶名叫虎田的人家，以便從現任家主虎田直信那裡獲知，有關不久前他的兒子義郎遭遇龍捲風摔死的事情。是誰對瀕死的義郎見死不救呢，直信的妻子達榮認為是和虎田家有過節的龍尾家窩藏兇手。另一方面，龍尾家的住宅內，平次與和葉正在聽現任家主龍尾為史講述，有關不久前他的兒子康司被人綁架殺害的事情。為史的母親盛代則認為義郎的死是對龍尾家充滿憎恨的虎田家的某人為了殺害康司的藉口罷了。接受各自委託的柯南、平次在調查案件的過程中相遇，便決定共同探究事件的真相。但是，柯南和平次在發現犯人前，一起新的殺人事件卻發生了…
特輯28
TV 521《殺人犯，工藤新一》一小時特別篇
日文標題：殺人犯 工藤新一
對應漫畫：Vol.62 File.5-File.9
播映時間：2009年1月19日
劇情簡介：收到自稱屋田誠人寄來的關於1年前工藤新一所破解的殺人事件的推理存在疑點的信的平次，約上小五郎、柯南、小蘭、和葉前往東奧穗村。平次等人在拜訪村公所的時候，柯南則獨自一人進入了森林。原來隨信還有附寄給新一的一封信，約在山中小屋見面。此時，柯南突然感到莫名的痛苦。原來柯南在感冒後，從阿笠博士那裡得到的藥，居然是小哀研究出的APTX4869的解毒剤的試製品。小蘭等人為尋找柯南，進入森林，卻意外與新一相見。但是，新一因喪失記憶，甚至連小蘭都忘記是誰了…
特輯29
TV 522《新一的真實身份和小蘭的眼淚》一小時特別篇
日文標題：新一の正體に蘭の涙
對應漫畫：Vol.62 File.9-File.10
播映時間：2009年1月26日
劇情簡介：從山路滾落失去意識的小蘭，夢見了在多羅碧加樂園一去不回的新一，醒來後，發現自己躺在一個山上的小屋裡。此時，平次他們推門而入，並對小屋和旁邊屋子進行了調查，發現了裝子彈的空盒和貼滿新一的新聞報導的牆壁，平次斷定這是死亡羅神的落腳點。
之後，平次又發現了柯南留下的腳印，開始懷疑出現在大家面前的“工藤新一”的真實身份。
平次召集大家來到刑警跟前，宣布刺傷報社記者的人就是“工藤新一”！！“工藤新一”在眾人面前痛哭流涕地述說原因，蘭對這樣的新一感到非常地陌生，死亡羅神的身影再次出現在屋外...!!
特輯30
TV 651《柯南VS平次 東西偵探推理對決》一小時特別篇
日文標題：コナンvs平次 東西探偵推理勝負
對應漫畫：Vol.74 File.5-File.7
播出時間：2012年3月24日
劇情簡介：服部同和葉到東京來，和葉在車上看見一家上次買過的土產店於是下車去買，卻撞上了一起看似自殺的他殺案件，正好在事務所的世良知道後便提議利用這個事件分出東西名偵探哪個更厲害。
而這個案件死者的第一目擊者正好是FBI的卡梅隆搜查官，卡梅隆搜查官拍下前去的世良的照片並發給茱蒂，茱蒂覺得她似曾相識，而詹姆斯一眼就知道世良是女的，卻說他不認識世良，這其中有什麼隱情嗎？
事件之後，則是服部帶來的新事件。
旅遊特輯
自2001年以來，國小館開始進行“旅遊篇”特別策劃。每年製作1-2次，均為動畫原創故事，描寫主人公到日本一些著名的景點時遇到事件，也介紹了當地的名勝和文化特色。| 集數 | 名稱 | 播放時間 | 主要景點 | 收視率 |
|---|---|---|---|---|
| 236 | 南紀白濱的神秘之旅，上集 | 2001年6月4日 | 白濱溫泉、三段壁、白良濱（和歌山縣） | 14.7% |
| 237 | 南紀白濱的神秘之旅，下集 | 2001年6月11日 | 17.7% | |
| 255 | 松江玉造連句大戰十四回合，上集 | 2001年10月29日 | 松江城（島根縣松江市） | 19.3% |
| 256 | 松江玉造連句大戰十四回合，下集 | 2001年11月5日 | 18.6% | |
| 299 | 關門海峽的友情與殺機，上集 | 2002年11月4日 | 關門海峽（本州與九州交界處） | 16.3% |
| 300 | 關門海峽的友情與殺機，下集 | 2002年11月18日 | 15.3% | |
| 342 | 豪斯登堡的新娘 | 2003年11月17日 | 豪斯登堡（長崎縣佐世保市大灣村） | 12.9% |
| 377 | 桃太郎猜謎之旅，上集 | 2004年11月8日 | 倉敷市（岡山縣） | 14.9% |
| 378 | 桃太郎猜謎之旅，下集 | 2004年11月15日 | 15.0% | |
| 419 | 八歧大蛇之劍，上集 | 2005年11月7日 | 出雲市（島根縣） | 11.2% |
| 420 | 八歧大蛇之劍，下集 | 2005年11月14日 | 10.7% | |
| 518 | 明治維新神秘之旅（探索篇） | 2008年12月1日 | 美彌郡秋吉台國家公園 - 秋芳洞（山口縣） | 8.8% |
| 519 | 明治維新神秘之旅（解讀篇） | 2008年12月8日 | 7.7% | |
| 554 | 鸛的探秘之旅（小蘭搜查篇） | 2009年11月7日 | 城崎溫泉（兵庫縣） | 9.6% |
| 555 | 鸛的探秘之旅（陽菜追蹤篇） | 2009年11月14日 | 10.6% | |
| 594 | 廣島宮島的七大不可思議之旅（宮島篇） | 2010年11月6日 | 廣島、宮島（廣島縣） | 9.7% |
| 595 | 廣島彌山的七大不可思議之旅（廣島篇） | 2010年11月13日 | 10.0% | |
| 640 | 八張素描畫的記憶之旅（岡山篇） | 2011年12月10日 | 倉敷市（岡山縣） | 9.7% |
| 641 | 八張素描畫的記憶之旅（倉敷篇） | 2011年12月17日 | 9.2% | |
| 678 | 長崎謎之劇場（幕末篇） | 2012年12月1日 | 長崎市（長崎縣） | 9.1% |
| 679 | 長崎謎之劇場（現代篇） | 2012年12月8日 | 11.4% | |
| 720 | 火與水的神秘之旅（阿蘇篇） | 2013年11月30日 | 阿蘇市（熊本縣） | 10.0% |
| 721 | 火與水的神秘之旅（熊本篇） | 2013年12月7日 | 9.3% |
合作特輯
合作製作《魯邦三世vs名偵探柯南》兩小時特別版日文標題：ルパン三世VS名探偵コナン
收視率：19.5%（首播）、15.2%（重播）、12.4%（重播）
播出時間：2009年3月27日（首播）、2012年3月23日（重播）、2013年12月6日（重播）
《魯邦三世VS名偵探柯南》是動漫作品《魯邦三世》和《名偵探柯南》共同製作的一部動畫特輯，於2009年3月27日在日本黃金時間電視台播映。
劇情簡介：在維斯巴尼亞王國，女王——薩克拉死於獵槍走火事故，而王國的王子——吉爾，因母親由於自己的獵槍走火死亡而過度自責，最後以手槍自殺身亡。慘劇的訊息迅速傳播，轟動各國新聞界，當然，也傳到了江戶川柯南和魯邦三世耳里……
女王及王子的死，使公主——米拉將繼承王位成為下屆女王。當米拉女王
慘劇背後隱藏著怎樣的秘密？“平成年代的福爾摩斯，日本警察的救世主”工藤新一（江戶川柯南）對決“世紀大盜”魯邦三世！ 勝利歸向何方？
特輯：魔術快斗
簡介
此系列以“夏之怪盜基德祭”“怪盜基德特別篇”“冬之怪盜基德祭”為名播出，全部以怪盜基德為主角。包含了《魔術快斗》動畫第2～12集，但官方並不將其計入《名偵探柯南》動畫目錄中。此系列不同於一般所說的“長篇版特輯”。《魔術快斗》DVD版中已將其作為《魔術快斗》正式動畫版。其中M14公開紀念特輯《怪盜基德誕生的秘密》改編自《魔術快斗》動畫第一集《復活的怪盜》。而《復活的怪盜》是《魔術快斗》正式動畫，《怪盜基德誕生的秘密》則是《名偵探柯南》播出的《魔術快斗》特輯。
其中《淚之水晶之母》與《名偵探柯南》OVA 4《柯南、基德與水晶之母》改編自《魔術快斗》同一篇漫畫。《淚之水晶之母》為重新製作版，並非OVA 4的數碼重映。OVA 4對漫畫劇情進行了改編，因此已經與《魔術快斗》主線劇情無關聯，更加入了柯南主角群；重新製作的《淚之水晶之母》則是對《魔術快斗》主線劇情的補完，且未加入柯南主角群。
魔術快斗相關特輯列表
| 1 | 怪盜基德誕生的秘密 | 2010年4月24日 | Vol.1 File.1 | 8.0% |
|---|---|---|---|---|
| 2 | 怪盜基德忙碌的約會 | 2011年8月6日 | Vol.1 File.4 | 9.4% |
| 3 | 公主殿下愛魔術 | 2011年8月13日 | Vol.1 File.2 | 7.6% |
| 4 | 魔女不流眼淚 | 2011年9月24日 | Vol.1 File.6 & Vol.2 File.4 | 10.1% |
| 5 | 命運的藍色生日 | 2011年10月29日 | Vol.3 File.5 | 9.6% |
| 6 | 戀愛滑雪場的聖誕夜 | 2011年12月24日 | Vol.2 File.1 | 9.1% |
| 7 | 華麗的對手們 | 2012年8月4日 | Vol.3 File.2~3 （有原創劇情） | 7.4% |
| 8 | 紅色之淚的秘密 | 2012年8月11日 | Vol.4 File.2 | 8.3% |
| 9 | 魔女與偵探與怪盜 | 2012年9月29日 | Vol.3 File.4 （有原創劇情） | 9.7% |
| 10 | 追憶的黃金之眼 | 2012年11月3日 | Vol.4 File.5~6 | 8.4% |
| 11 | 淚之水晶之母 | 2012年12月22日 | Vol.4 File.1 | 7.4% |
| 12 | 暗夜騎士愛的眼淚 | 2012年12月29日 | Vol.4 File.7~8 | 5.5% |
分集劇情
第1集 復活的怪盜消失8年、如今突然復出的神秘怪盜——怪盜基德，引起了喜愛魔術表演的高中生黑羽快斗的注意，因為他父親、世界知名魔術師黑羽盜一也是8年前去世的。
同時，快斗發現了家中的密室，其中竟然存放著基德的服裝？！快斗決定穿上基德服裝，去今晚基德的預告現場去一探究竟…
第2集 怪盜基德忙碌的約會
快斗從父親生前的助手寺井黃之助口中得知父親盜一便是怪盜基德。但當問及父親死因等問題時，寺井卻閉口不答。為了追查父親的死因，快斗決定成為第二代基德活動，以發現線索。
但在一次行動中，中森警部看到了快斗的臉，中森青子又在預告當天邀請快斗約會，快斗身份即將曝光？！
第3集 公主殿下愛魔術
歐洲沙伯利那公國遠道而來的可愛公主，帶來了歐洲最大的鑽石。但跟來的外國刑警卻自負地發表了逮捕怪盜基德的宣言，並讓中森警部臉面掃地。基德將如何既滿足公主觀看魔術表演的願望，又幫助中森挽回在外國刑警面前丟失的顏面？
第4集 魔女不流眼淚
快斗的班上轉來了一位美麗的少女，而這個名叫小泉紅子的女孩居然是位魔女！不僅通過占卜知曉快斗身份，而且當得知快斗是唯一不會屈服於自己美貌的男性後，決定殺死快斗！…
第5集 命運的藍色生日
快斗在偷竊中遇到了一個神秘組織，而他們居然稱呼基德為“黑羽盜一”！難道他們就是8年前暗殺黑羽盜一的人？快斗中後槍從樓頂墜落…今天還是中森青子的17歲生日，快斗還能照約前來嗎？
第6集 聖夜在戀愛的滑雪場
上次行動失敗後，紅子便想盡一切辦法讓快鬥成為自己的俘虜。
聖誕節就要到了，快斗班去滑雪場學習滑雪。老師準備了聖誕夜化裝滑雪大賽，必須男女生兩人一組，在聖誕夜留下美好回憶。青子因為不自信而沒敢邀請快斗，她能如願以償嗎？紅子的能得到快斗的青睞嗎？
第7集 華麗的對手們
從倫敦歸來、令世人矚目的高中生偵探白馬探，將與怪盜基德進行對決！但是另一個神秘而恐怖的對手——神秘組織的殺手“蜘蛛”也將登場！
兩位華麗宿敵的輪番對陣，基德將如何應對？
第8集 紅色之淚的秘密
基德在得知自己下一個目標是霍伯馬戲團的鎮團之寶“紅色之淚”後，毅然放棄盜竊！但神秘組織卻依然覬覦著這塊寶石，基德決定挺身保護。基德與這塊寶石的有何淵源？
第9集 魔女與偵探與怪盜
白馬探在與基德的多次對決中失利，但是沒有放棄的他終於發現了基德的重大線索，基德的身份即將被曝光！？小泉紅子為了保護基德而做出大膽妄為的舉動…然而意想不到的是，“蜘蛛”又再次出現了？！
第10集 追憶的黃金之眼
來自法國的怪盜黑貓向基德下了戰書。兩位怪盜共同爭奪嚴密安保措施下的貓眼石“黃金之眼”，勝利將會歸向何方？精彩的爭奪戰背後，怪盜黑貓的真正身份又是…
第11集 淚之水晶之母
英格拉姆公國女王佩戴歐洲最大的黃寶石“水晶之母”到日本訪問，基德準備在列車上盜取寶石，而神秘組織也在列車上蠢蠢欲動…
第12集 暗夜騎士愛的眼淚
神秘的犯罪策劃人“夢魘”以揭穿基德身份為威脅，強迫基德與他合作。而來自ICPO（國際刑警組織）的大人物傑克·康納利也趕來協助調查，白馬探也特地趕回日本。多方力量的參與之下，事件背後驚人的真相居然是？！…
| 集數 | 動畫開場白內容 |
|---|---|
| 1 | 無 |
| 2-5 7-12 | 別忘記撲克臉，胸中懷揣父親的教導，飛馳於摩天樓間的奇蹟般的魔術師，怪盜基德登場！今天的目標是（***）。好了，表演要開始了！ |
| 6 | 別忘記撲克臉，胸中懷揣父親的教導，飛馳於摩天樓間的奇蹟般的魔術師——“怪盜基德，你給我覺悟吧！（紅子語）” “什麼？！紅子？！（快斗語）”“今天的目標是快斗的真心喔！（紅子語）” |
註：
1.（***）表示提到的怪盜基德的盜竊目標。
2.《魔術快斗》第1集獨立播出時無開場白，在改編為《名偵探柯南》“M14紀念特別篇版”後所使用的開場白是：“花伴隨鋼琴的鏇律飛舞，二人面對面卻充滿神秘，今天是特別又特別的一篇，怪盜基德誕生的秘密將完全展露，唯一看透了真相的，是一個外表看似小孩，智慧卻過於常人的名偵探柯南！”
